污水处理厂在持有排污许可证的情况下，若违反相关规定，仍需承担相应的法律责任，主要包括行政责任、民事责任和刑事责任。以下是对这些责任的详细分析：
一、行政责任
超标排污或违规排污的行政处罚：
- 根据《中华人民共和国水污染防治法》等相关法律法规，污水处理厂若超过国家或地方规定的污染物排放标准排放污水，或者未按照排污许可证的规定排放污染物，环保主管部门有权责令其限期改正，并处以罚款。罚款的数额根据违法行为的情节轻重和造成的后果严重程度而定，可能从数万元到数百万元不等。
- 若污水处理厂在限期改正期限内仍未达到整改要求，环保主管部门可以责令其停产整治，甚至吊销其排污许可证。
未按规定进行监测或报告的行政处罚：
- 污水处理厂需按照排污许可证的要求定期进行自行监测，并向环保主管部门提交排污报告。若未按规定进行监测或报告，或者监测数据不真实、不准确，环保主管部门同样有权对其进行处罚，包括罚款、责令改正等。
二、民事责任
环境污染侵权责任：
- 若污水处理厂的排污行为导致周边环境受到污染，进而对他人的人身、财产造成损害，污水处理厂需承担环境污染侵权责任。这包括赔偿受害人的医疗费、财产损失、精神损害抚慰金等。
- 在环境污染侵权纠纷中，实行举证责任倒置原则，即由污水处理厂承担证明其排污行为与损害结果之间不存在因果关系的举证责任。若无法证明，则推定存在因果关系，污水处理厂需承担赔偿责任。
生态修复责任：
- 除了对受害人的直接赔偿外，污水处理厂还需承担生态修复责任。即采取措施恢复被污染的环境至原有状态或达到可接受的水平。这可能包括清理污染物、修复受损的生态系统等。
三、刑事责任
- 污染环境罪：
- 若污水处理厂的排污行为严重污染环境，构成犯罪的，将依法追究其刑事责任。根据《中华人民共和国刑法》第三百三十八条的规定，污染环境罪是指违反国家规定，排放、倾倒或者处置有放射性的废物、含传染病病原体的废物、有毒物质或者其他有害物质，严重污染环境的行为。
- 对于构成污染环境罪的污水处理厂及其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，将处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金；后果特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。
法律建议
严格遵守排污许可证要求：
- 污水处理厂应严格按照排污许可证的要求进行排污，确保排放的污染物种类、数量、浓度等均符合规定标准。
加强内部管理：
- 建立健全内部管理制度，加强员工培训，提高环保意识，确保污水处理设施的正常运行和监测数据的真实准确。
积极应对环境纠纷：
- 在发生环境纠纷时，污水处理厂应积极与受害人协商解决，承担应尽的责任。同时，及时向环保主管部门报告，配合调查处理工作。
关注政策变化：
- 随着环保政策的不断更新和完善，污水处理厂应密切关注相关政策变化，及时调整自身的排污行为和管理策略，以适应新的环保要求。
作为宿梦醒律师，我专注于刑事辩护和侵权纠纷领域，若您在污水处理厂排污许可证相关责任方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。