在探讨央企在京老旧小区综合整治项目是否能与房屋所有人签订协议的问题时，我们首先要明确这类项目的性质、实施主体以及相关的政策导向。
一、项目性质与实施主体
央企在京老旧小区综合整治项目，通常是由政府主导，央企作为实施主体，旨在改善老旧小区的居住环境，提升居民的生活质量。这类项目往往涉及多个方面，包括但不限于房屋外墙保温、外门窗改造、屋面防水保温、基础设施改造等。实施主体（央企）在获得政府相关部门的批准和资金支持后，会按照既定的规划和标准进行改造。
二、政策导向与居民参与
从政策层面来看，老旧小区综合整治项目强调“双纳入”工作机制，即各区需及时与产权单位及实施主体对接，配合开展居民工作。这意味着在项目实施过程中，居民（即房屋所有人）的参与和配合是至关重要的。虽然直接的政策文件可能并未明确提及“与房屋所有人签订协议”，但根据项目的性质和实施方式，可以合理推断，在项目实施前或实施过程中，实施主体（央企）会与房屋所有人进行充分沟通，并就改造内容、方式、时间等关键事项达成一致意见。
三、协议签订的可能性与必要性
可能性：在老旧小区综合整治项目中，为了确保改造工作的顺利进行和居民的合法权益得到保障，实施主体（央企）与房屋所有人签订协议是可能的。这种协议可以明确双方的权利和义务，包括改造内容、质量标准、工期安排、费用承担等关键条款。
必要性：签订协议对于双方来说都是必要的。对于实施主体（央企）而言，协议可以确保改造工作的顺利进行，避免因居民不配合或提出额外要求而导致的工期延误或成本增加。对于房屋所有人而言，协议可以保障其合法权益不受侵害，确保改造后的房屋符合其期望和需求。
四、实际操作中的建议
在实际操作中，如果央企在京老旧小区综合整治项目确实需要与房屋所有人签订协议，建议采取以下步骤：
充分沟通：在项目实施前，实施主体（央企）应与房屋所有人进行充分沟通，了解其需求和期望，并就改造内容、方式等关键事项达成初步共识。
制定协议草案：根据沟通结果，实施主体（央企）应制定详细的协议草案，明确双方的权利和义务、改造内容、质量标准、工期安排、费用承担等关键条款。
征求意见与修改：将协议草案征求房屋所有人的意见，并根据其反馈进行修改和完善，确保协议内容符合双方利益。
正式签订协议：在双方对协议内容达成一致后，正式签订协议，并按照协议约定履行各自的权利和义务。
综上所述，央企在京老旧小区综合整治项目在实施过程中，为了确保改造工作的顺利进行和居民的合法权益得到保障，与房屋所有人签订协议是可能且必要的。在实际操作中，双方应充分沟通、制定详细的协议草案、征求意见与修改，并最终正式签订协议。