结论：二手房他项权证中的借款合同不能用别的合同代替。

分析说明：

1. 他项权证的法律性质：

   • 他项权证是房屋产权登记机关颁发给抵押权人或者典权人等他项权利人的法定凭证。它表明了除房屋所有权人之外的其他权利人对该房屋享有的某种特定权利，如抵押权。
   • 在二手房交易中，如果房屋已经设定了抵押，那么购房者（或新的抵押权人）在办理他项权证时，必须依据原有的借款合同（即抵押合同）来办理，因为这是抵押权设立的基础。

2. 借款合同的特定性：

   • 借款合同是抵押权设立的法律依据，它详细规定了借款金额、利率、还款期限、抵押物等关键条款。这些条款是他项权证内容的重要组成部分，也是抵押权人行使权利的基础。
   • 如果用别的合同代替原有的借款合同，那么新的合同可能无法准确反映抵押权的设立情况，导致他项权证的内容与实际情况不符，进而引发法律纠纷。

3. 法律后果与风险：

   • 擅自用别的合同代替原有的借款合同来办理他项权证，可能构成违法行为，如伪造、变造国家机关证件等，将面临法律制裁。
   • 即使新的合同在形式上符合他项权证的要求，但由于其内容与实际情况不符，也可能导致抵押权无法有效设立或行使，给抵押权人带来经济损失。

法律建议：

• 在二手房交易中，如果房屋已经设定了抵押，购房者（或新的抵押权人）应仔细审查原有的借款合同，确保他项权证的办理依据真实、合法、有效。
• 如果需要对借款合同进行变更或补充，应依法办理相关手续，如签订补充协议、办理抵押权变更登记等，以确保他项权证的准确性和合法性。
• 如果在办理他项权证过程中遇到任何问题或疑问，应及时咨询专业律师或相关机构，以避免法律风险。

总结：二手房他项权证中的借款合同是抵押权设立的基础和法律依据，具有特定性和不可替代性。因此，不能用别的合同来代替原有的借款合同来办理他项权证。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。