结论：在“没收违法所得”的行政处罚或司法决定已作出，但尚未实际收到款项的情况下，从法律执行的角度，仍应视为“应当没收”，并继续推进执行程序以确保违法所得被依法收缴。以下从不同角度进行详细分析：
一、法律决定的效力与执行
法律决定的既定效力：一旦行政机关或司法机关作出“没收违法所得”的决定，该决定即具有法律效力，对当事人产生约束力。这意味着，无论款项是否已实际收缴，决定本身已经确定了违法所得的没收性质。
执行程序的推进：在决定作出后，执行机关（如行政机关的执行部门或法院的执行庭）有责任推进执行程序，包括通知当事人缴纳、采取强制执行措施等，以确保违法所得被依法收缴。因此，即使款项尚未收到，执行程序仍应继续进行。
二、未收到款项的原因与处理
当事人未履行：如果当事人未按照决定要求主动缴纳违法所得，执行机关应依法采取强制执行措施，如查封、扣押、拍卖财产等，以强制当事人履行缴纳义务。
执行障碍与应对：在执行过程中，可能会遇到各种障碍，如当事人财产隐蔽、转移或不足以清偿违法所得等。此时，执行机关应依法调查当事人的财产状况，并采取相应的执行措施，如追加被执行人、限制高消费、纳入失信被执行人名单等，以促使当事人履行义务。
三、法律后果与责任
当事人的法律责任：如果当事人拒不履行缴纳违法所得的义务，将面临更严厉的法律后果，如被处以罚款、拘留等行政处罚，甚至可能构成犯罪，被追究刑事责任。
执行机关的责任：执行机关在推进执行程序过程中，应依法履行职责，确保执行程序的合法性和有效性。如果因执行机关的过错导致违法所得未能及时收缴，执行机关可能需承担相应的法律责任。
四、实际操作建议
及时沟通与配合：对于当事人而言，应积极与执行机关沟通，了解执行进展和自身义务，并主动配合执行工作，以尽快履行缴纳违法所得的义务。
寻求法律援助：如果当事人在执行过程中遇到困难或争议，可以寻求专业律师的法律援助，以维护自身合法权益。
监督执行程序：当事人和利害关系人有权对执行程序进行监督，如果发现执行机关存在违法行为或不当行为，可以向相关部门投诉或举报。
总结来说，在“没收违法所得”的决定已作出但尚未收到款项的情况下，仍应视为“应当没收”，并继续推进执行程序。当事人应积极配合执行工作，执行机关应依法履行职责，确保违法所得被依法收缴。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。