在电瓶车交通事故责任认定书出具后，对方被认定为次要责任，后续处理主要围绕赔偿协商、保险理赔及可能的诉讼程序展开。具体处理方式如下：
赔偿协商：
- 责任比例确定：根据责任认定书，对方承担次要责任，通常意味着您（或您的保险公司）将承担主要赔偿责任。具体比例可能因地区和案件情况而异，但一般次要责任方承担的比例在20%-40%之间。
- 协商内容：双方应就赔偿项目（如医疗费、误工费、车辆维修费等）及金额进行协商。协商时，应确保所有费用都有合理依据，如医疗发票、维修清单等。
- 协商结果：若双方达成一致，可签订书面赔偿协议，明确赔偿金额、支付方式及时间等条款。
保险理赔：
- 报案与提交材料：若您或对方购买了相关保险（如交强险、商业三者险等），应及时向保险公司报案，并提交事故认定书、医疗证明、维修发票等理赔材料。
- 理赔流程：保险公司将根据保险条款及事故责任比例进行理赔审核。审核通过后，保险公司将直接支付赔偿款给受损方或您（若您已先行垫付）。
- 注意事项：在理赔过程中，应确保所有材料真实、完整，避免因材料不全或虚假导致理赔受阻。
诉讼程序：
- 协商不成：若双方无法就赔偿问题达成一致，受损方有权向法院提起诉讼，要求对方及保险公司（如涉及）承担赔偿责任。
- 诉讼准备：在提起诉讼前，应收集并整理好所有相关证据材料，如事故认定书、医疗记录、维修发票等。同时，可咨询专业律师以了解诉讼流程及可能的风险。
- 诉讼过程：法院将依法审理案件，并根据事实及法律规定作出判决。判决生效后，若对方未履行赔偿义务，您可申请法院强制执行。
在处理过程中，建议您保持冷静、理性，通过合法途径维护自己的权益。若您在处理过程中遇到任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。