结论前置：法人（即公司法定代表人）不能在股东不知情的情况下擅自变更，该变更行为通常是非法的，且可能无效。股东有权通过法律途径维护自身合法权益。
一、法律依据与程序要求
《中华人民共和国公司法》相关规定：
- 根据《公司法》第十三条，公司法定代表人由公司章程规定，并由董事长、执行董事或经理担任，变更时需依法登记。这意味着，法定代表人的变更必须遵循公司章程和法律规定的程序。
- 《公司法》第一百零三条规定，股东大会作出关于修改公司章程、增减注册资本、公司合并分立解散或变更形式的决议，需经出席会议股东所持表决权三分之二以上通过（公司章程另有规定的除外）。法人变更作为公司重大事项之一，同样需要遵循严格的表决程序。
《中华人民共和国企业法人登记管理条例》相关规定：
- 根据《条例》第十七条和第十八条，企业法人变更法定代表人等关键信息时，应申请办理变更登记，并在主管部门或审批机关批准后三十日内完成登记手续。这强调了变更登记的法定性和时效性，也意味着变更必须经过合法程序并得到相关部门的认可。
二、变更程序的合法性分析
- 有限责任公司或股份有限公司更换法定代表人，需由股东会、股东大会或董事会召开会议并作出决议。若原法定代表人无法履行职责导致会议无法召开，可由半数以上董事推选代表或出资最多/持股最大的股东召集会议并作出决议。但无论如何，任何未经合法程序召开的会议或未获必要表决权通过的决议，均不能作为变更法定代表人的有效依据。
- 若在股东不知情的情况下擅自变更法人，该变更行为将因缺乏合法程序和股东同意而无效。股东作为公司的出资人，享有对公司重大事项的知情权和决策权，法人变更作为公司重大事项之一，必须确保股东的参与和表决。
三、股东权利与救济途径
股东知情权与表决权：
- 股东有权了解公司的运营情况和重大事项，包括法定代表人的变更。若股东在不知情的情况下被变更了法人，其知情权和表决权均受到了侵害。
法律效力瑕疵与救济：
- 若未经股东会合法表决程序擅自变更法人，该变更行为存在法律效力瑕疵。股东有权向法院提起诉讼，要求确认变更行为无效或撤销变更登记，以维护自身合法权益。
行政途径：
- 股东还可以向公司登记机关反映情况，并提交相关证明材料，申请登记机关撤销该变更登记。登记机关经调查核实后，有权撤销不符合法律规定的变更登记。
四、特殊情况处理
- 虽然一般情况下需遵循上述程序，但若公司章程有特别约定，在某些紧急或特定条件下可不经全体股东一致同意变更法人。然而，这种约定也必须符合法律的强制性规定和基本原则，不能损害股东的合法权益。
五、总结与建议
- 总结：变更法人必须严格遵循法定程序和保障股东的知情权与表决权。任何在股东不知情情况下擅自进行的法人变更都是违法的，且可能导致变更行为无效。
- 建议：股东应密切关注公司动态，及时行使自己的权利，确保公司运营的合法性和规范性。若发现法定代表人在其不知情的情况下被变更，股东应首先尝试通过内部协商解决，若无法解决，则可通过行政途径或司法途径维护自己的合法权益。
作为专业律师，我建议您在遇到类似问题时，及时咨询并寻求专业法律帮助，以确保您的权益得到充分保障。