工作12小时不允许吸烟是否违法，需分情况讨论：
从劳动法角度分析：
- 核心前提：劳动法主要关注的是劳动者的工作条件、工作时间、休息休假、劳动安全卫生等权益。关于吸烟，劳动法并未直接规定劳动者在工作时间内是否可以吸烟，这通常取决于用人单位的规章制度。
- 法律解释：如果用人单位的规章制度中明确规定了工作时间内禁止吸烟，且该制度不违反法律法规的强制性规定，也不侵犯劳动者的合法权益（如合理的休息时间、健康权益等），那么用人单位有权要求劳动者遵守这一规定。因此，在用人单位有明确规定且规定合法的情况下，工作12小时不允许吸烟并不违法。
- 特殊情况：如果用人单位的规章制度过于严苛，比如完全剥夺了劳动者在长时间工作期间的合理休息和放松时间，包括吸烟时间，且这种剥夺对劳动者的身心健康造成了不合理的影响，那么这种规定可能因违反劳动法的精神（如保障劳动者身心健康）而被视为无效或可撤销。但这种情况需要具体评估，不能一概而论。
从公共场所卫生管理角度分析：
- 核心前提：除了劳动法外，还需要考虑公共场所卫生管理方面的法律法规。例如，《公共场所卫生管理条例》等可能对公共场所的吸烟行为有所限制。
- 法律解释：如果工作场所被认定为公共场所（如某些大型工厂、办公楼等），且相关法律法规明确禁止在该类场所内吸烟，那么无论工作时间长短，劳动者都不得吸烟。在这种情况下，工作12小时不允许吸烟是合法的，且是遵守公共场所卫生管理规定的必要举措。
- 特殊情况：如果工作场所不属于公共场所，或者相关法律法规未对该类场所的吸烟行为作出明确限制，那么用人单位的禁止吸烟规定就主要依据其内部规章制度来执行。
从劳动者权益保护角度分析：
- 核心前提：劳动者在长时间工作过程中，有权享受合理的休息和放松时间，包括吸烟时间（如果劳动者有吸烟习惯的话）。
- 法律建议：如果用人单位的禁止吸烟规定过于严苛，影响了劳动者的合理休息和身心健康，劳动者可以与用人单位协商调整相关规定，或者通过劳动争议调解、仲裁等途径维护自己的合法权益。在协商或争议解决过程中，劳动者应提供充分的证据证明自己的权益受到了不合理侵害。
总结与建议：工作12小时不允许吸烟是否违法，取决于用人单位的规章制度是否合法、工作场所是否属于公共场所以及相关法律法规的具体规定。如果用人单位的规章制度合法且合理，且工作场所不属于公共场所或相关法律法规未明确禁止吸烟，那么用人单位有权要求劳动者遵守禁止吸烟的规定。但如果该规定过于严苛或违反了相关法律法规的精神，劳动者有权提出异议并寻求法律救济。如果你对此有疑问或认为自己的权益受到了侵害，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。