核心结论：司机闯红灯的处理需分情况讨论，主要涉及交通违法处罚、雇主责任承担及后续纠纷解决三个层面，具体如下：

1. 司机作为直接责任人的处理
   根据《道路交通安全法》第90条，闯红灯将面临罚款200元、记6分的行政处罚，由司机本人承担。若司机对处罚有异议（如信号灯故障、避让特种车辆等），可申请行政复议或提起行政诉讼，但需在收到处罚决定书后60日内提出。

2. 雇主可能承担的连带责任

   • 民事赔偿层面：若闯红灯导致第三方人身或财产损失，根据《民法典》第1191条，雇主需承担替代赔偿责任，但事后可向有过错的司机追偿。例如，司机因故意或重大过失（如酒驾、超速）导致事故，雇主赔偿后可全额追偿；若仅为一般过失（如疏忽观察），雇主可能需分担部分责任。
     
   • 劳动纪律层面：若司机与雇主存在劳动关系（如签订劳动合同），雇主可依据内部规章制度（如《员工手册》）对司机进行警告、扣发奖金等处分，但需确保制度内容合法且已向司机公示。

3. 雇主与司机的风险防范建议

   • 事前预防：雇主应在雇佣合同中明确约定交通违法责任条款（如“因司机交通违法导致雇主损失的，司机需全额赔偿”），并定期组织交通安全培训。
     
   • 事中管理：为车辆安装行车记录仪，保留司机驾驶行为的证据；要求司机出车前检查车辆状况（如刹车、灯光），避免因车辆故障导致违法。
     
   • 事后处理：若发生事故，雇主应第一时间报警并固定证据（如现场照片、监控录像），同时与司机沟通责任分担方式，避免矛盾激化。

特殊情形提示：若司机闯红灯系执行雇主指令（如雇主要求“赶时间”），雇主可能构成共同侵权，需与司机承担连带赔偿责任。此时雇主需证明“指令与违法无因果关系”（如司机可拒绝违法指令），否则难以免责。

如有进一步疑问（如具体案件责任划分、赔偿金额计算等），可直接向我咨询。