结论：旷工两天自动离职的情况下，劳动者通常仍有权获得其实际工作期间的工资，但具体发放情况需结合公司规定和实际情况判断。

一、工资支付的基本原则

根据《中华人民共和国劳动法》第五十条的规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这一原则同样适用于旷工后自动离职的情况。即使员工因旷工被解除劳动合同，其已提供正常劳动的时段仍应获得相应工资。例如，若员工月薪为6000元，若旷工前已完成15天工作，则企业应支付其半个月工资（按实际出勤天数和约定的日工资标准计算）。

二、旷工与工资扣除的合法性边界

1. 公司规章制度：企业可通过内部制度对旷工行为进行约束，但需符合以下条件：

   • 制度公示性：规章制度须经民主程序制定并向员工公示；
   • 扣款合理性：仅可扣除旷工当日的缺勤工资，不得克扣其他正常工作日的报酬；
   • 最低工资保障：扣除后实发工资不得低于当地最低工资标准。

2. 具体计算：若员工旷工两天，企业通常只能扣除这两天的工资，而不能扣除其他正常工作日的工资。例如，若员工日工资为200元，旷工两天则最多扣除400元，剩余工资仍需支付。

三、特殊情形下的工资处理规则

1. 经济损失追偿：若旷工导致企业直接损失（如设备损坏、项目延误等），企业可依据《工资支付暂行规定》第十六条要求赔偿，但需通过协商或法律途径主张，不可单方面从工资中抵扣。赔偿金额需以实际损失为限，且一般不超过劳动者当月工资的20%。

2. 福利津贴结算：交通补贴、餐补等与工作出勤挂钩的福利，可按实际出勤天数核算发放。若员工旷工两天，则这两天的福利津贴可能不予发放。

四、争议解决路径建议

若企业对旷工员工采取全额扣发、拒付全部工资等行为，可能构成违法。员工可通过以下方式维权：

1. 向劳动监察部门投诉：要求责令企业限期支付工资；
2. 申请劳动仲裁：主张补发工资及经济补偿金；
3. 提起诉讼：通过司法途径确认企业行为的违法性。

五、实际操作建议

1. 了解公司规定：在旷工前或旷工后，劳动者应首先了解公司的相关规定，包括旷工的处罚措施、工资扣除标准等。
2. 保留证据：劳动者应保留好与工作相关的证据，如考勤记录、工资条等，以便在发生争议时维护自己的权益。
3. 及时沟通：若因特殊原因无法按时出勤，劳动者应及时与公司沟通并说明情况，避免不必要的误解和纠纷。

总结：旷工两天自动离职的情况下，劳动者通常仍有权获得其实际工作期间的工资。但具体发放情况需结合公司规定和实际情况判断。若遇到企业违法扣发工资的情况，劳动者应及时通过法律途径维护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。