关于租户办理营业执照时房东是否有义务配合的问题，这主要取决于租赁合同的具体约定以及相关法律法规的规定。以下是对此问题的详细解答：
一、房东的配合义务
附随义务：
- 从法律层面讲，租赁合同中通常存在附随义务，即房东在租赁关系中有义务配合租客进行某些合理的活动，包括但不限于办理营业执照。这是因为租客租赁房屋往往是为了进行经营活动，而办理营业执照是经营活动的必要步骤。
合同明确约定：
- 如果租赁合同中有明确条款规定房东需要协助租客办理营业执照，那么房东就应当按照合同约定履行相应义务。这包括但不限于提供房屋产权证明、在相关文件上签字等。
二、房东拒绝配合的后果
构成违约：
- 如果房东无故拒绝配合租客办理营业执照，且租赁合同中对此有明确约定，那么房东的行为很可能构成违约。租客可以依据租赁合同的条款，追究房东的违约责任，要求赔偿相应损失。
影响经营的责任：
- 如果因为房东不配合，导致租客无法及时办理营业执照，进而影响到租客的正常经营活动，租客还可以通过法律途径要求房东承担相应责任，以此维护自己的合法权益。
三、建议与解决方案
协商解决：
- 在遇到房东拒绝配合的情况时，租客首先可以尝试与房东进行友好协商，明确告知房东其配合义务以及不配合可能带来的后果。通过沟通，往往能够找到双方都能接受的解决方案。
法律途径：
- 如果协商无果，租客可以寻求法律帮助，通过诉讼或仲裁等方式来维护自己的合法权益。在此过程中，租客需要保留好相关证据，如租赁合同、沟通记录等，以便在需要时提供证明。
四、特殊情况说明
- 需要注意的是，如果租客的经营活动对房屋或周边环境产生不良影响，房东可能需要配合相关部门的检查等工作。但这并非是基于办理营业执照的义务，而是基于房东对房屋使用情况的管理责任。
综上所述，房东在租户办理营业执照时是否有义务配合主要取决于租赁合同的约定以及相关法律法规的规定。在大多数情况下，房东有义务配合租客办理营业执照，以确保租客能够顺利进行经营活动。如果房东拒绝配合，租客可以通过协商或法律途径来维护自己的合法权益。