国家重大水利工程建设基金征收滞纳金是合法的。以下是对此问题的详细分析：

1. 法律依据与基金性质：

   • 国家重大水利工程建设基金（以下简称“重大水利基金”）是国家为支持南水北调工程、解决三峡工程后续问题以及加强中西部地区重大水利工程建设而设立的政府性基金。
   • 根据相关规定，省级电网企业、拥有自备电厂企业和地方独立电网企业应及时足额上缴重大水利基金，不得拖延缴纳。

2. 滞纳金的规定：

   • 对于逾期不缴纳重大水利基金的企业，从滞纳之日起，税务部门会按日加收滞纳部分2‰的滞纳金。
   • 这一规定旨在确保基金的及时足额征收，以支持国家重大水利工程建设项目的顺利进行。

3. 滞纳金征收的合法性：

   • 滞纳金作为一种经济制裁手段，在法律上具有明确的依据和合理性。它旨在督促纳税人或缴费人按时履行其义务，避免因拖延缴纳而给国家或社会造成损失。
   • 在国家重大水利工程建设基金的征收过程中，滞纳金的征收是合法的，也是必要的。它有助于维护基金的征收秩序，确保基金能够及时、足额地用于国家重大水利工程建设项目。

4. 对企业的建议：

   • 企业应严格遵守相关法律法规，按时足额上缴重大水利基金，避免因拖延缴纳而产生不必要的滞纳金。
   • 如遇特殊情况无法按时缴纳，企业应及时与税务部门沟通，寻求解决方案，以避免产生滞纳金等不必要的经济损失。

综上所述，国家重大水利工程建设基金征收滞纳金是合法的，企业应严格遵守相关法律法规，按时足额上缴基金，以维护基金的征收秩序和国家的重大水利工程建设项目的顺利进行。如有任何法律问题或疑虑，可直接向我咨询。