结论：被许可人基于行政许可取得的利益不受保护，但已取得的收益是否要被追回，需根据具体情况判断，一般而言，若收益合法且无违法情形，通常不会被追回；若收益系通过违法手段取得，则可能面临被追回的风险。
分析说明：
行政许可的合法性基础：
- 行政许可是行政机关根据公民、法人或者其他组织的申请，经依法审查，准予其从事特定活动的行为。被许可人基于合法的行政许可所取得的利益，原则上应受法律保护，但这种保护并非绝对，特别是当行政许可本身存在违法或不当情形时。
收益的合法性判断：
- 合法收益：若被许可人通过合法手段，依据行政许可从事相关活动并取得的收益，且该收益未违反法律法规的强制性规定，那么这部分收益通常应受到法律保护，不会被追回。
- 违法收益：若被许可人通过欺诈、贿赂等不正当手段取得行政许可，或者利用行政许可从事违法活动，那么其基于这些违法手段所取得的收益，则可能面临被追回的风险。此外，如果行政许可被撤销、撤回或确认无效，且被许可人因此获得了不当利益，行政机关也有权要求其返还。
行政机关的追回权：
- 行政机关在发现被许可人存在违法情形或不当得利时，有权依法采取措施，包括要求被许可人返还违法所得或不当利益。这种追回权是行政机关维护公共利益和社会秩序的重要手段。
法律后果与救济途径：
- 对于被追回的收益，被许可人若认为行政机关的决定存在错误或不当，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，以维护自己的合法权益。同时，如果被许可人的行为构成犯罪，还将依法承担刑事责任。
法律建议：
- 对于被许可人而言，应严格遵守法律法规和行政许可的规定，合法从事相关活动，避免通过违法手段获取利益。
- 若面临行政机关的追回决定，被许可人应仔细审查该决定的合法性和合理性，必要时寻求专业法律帮助，以维护自己的合法权益。
- 对于行政机关而言，在行使追回权时，应严格依法办事，确保决定的合法性和正当性，避免侵犯被许可人的合法权益。
特殊场景说明：
- 在某些特殊情况下，如行政许可的撤销、撤回或确认无效是由于行政机关的过错或违法行为导致的，且被许可人因此遭受了损失，那么被许可人还有权依法要求行政机关给予赔偿。这种情况下，已取得的收益是否会被追回以及赔偿的具体数额和方式，将需要根据具体情况和法律法规的规定进行判断和确定。
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