结论：在合同纠纷中，原告向被告索赔100万而被告不愿意赔偿时，法院是否会判赔偿50万，这并非一个固定的结果，而是取决于多种因素的综合考量。以下从不同角度进行分析：

1. 合同约定与违约情况：

   • 合同条款：首先，法院会审查合同中的相关条款，特别是关于违约责任和赔偿范围的约定。如果合同中明确规定了违约方应承担的赔偿金额或计算方式，且该条款合法有效，那么法院通常会依据合同条款进行判决。
   • 违约事实：其次，法院会确认被告是否存在违约行为，以及该违约行为是否给原告造成了实际损失。如果被告确实违约，且原告能够证明其因此遭受了损失，那么法院会考虑赔偿的合理性。

2. 实际损失与证据支持：

   • 实际损失：原告需要提供充分的证据证明其因被告的违约行为而遭受了实际损失，且该损失与违约行为之间存在因果关系。如果原告无法提供充分证据，或者损失金额难以确定，法院可能会根据实际情况进行酌定。
   • 证据支持：证据的充分性和可信度对法院的判决具有重要影响。原告应尽可能收集并提交与损失相关的所有证据，如合同、发票、收据、鉴定报告等，以支持其索赔请求。

3. 法院的自由裁量权：

   • 裁量范围：在合同纠纷中，法院在判决赔偿金额时享有一定的自由裁量权。这意味着法院可以根据案件的具体情况，如双方的过错程度、损失的大小、合同的履行情况等，对赔偿金额进行适当调整。
   • 公平原则：法院在行使自由裁量权时，会遵循公平原则，确保判决结果既不过分偏袒一方，也不过分苛责另一方。因此，即使原告索赔100万，法院也可能根据实际情况判决赔偿低于或高于该金额的数额，如50万或其他金额。

4. 可能的法律后果与建议：

   • 法律后果：如果法院判决被告赔偿的金额低于原告的索赔金额，原告需要接受这一结果，并按照判决履行相关义务。如果原告认为判决不公，可以在法定期限内提起上诉或申请再审。
   • 建议：在合同纠纷中，为了避免不必要的法律风险和损失，建议双方在签订合同时明确约定违约责任和赔偿范围，并在发生纠纷时及时咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。

举例说明：假设在一个买卖合同中，买方因卖方交付的货物存在质量问题而遭受了实际损失，买方因此向卖方索赔100万。在诉讼过程中，法院经过审理认为，虽然卖方确实存在违约行为，但买方的实际损失并未达到100万，且部分损失与卖方的违约行为之间不存在直接因果关系。因此，法院可能根据实际情况判决卖方赔偿买方50万或其他低于100万的金额。

总结：在合同纠纷中，法院判决赔偿金额并非固定不变，而是取决于合同约定、实际损失、证据支持以及法院的自由裁量权等多种因素。因此，无法简单地回答“法院会判赔偿50万吗”这一问题。如果您在合同纠纷中遇到类似问题，建议直接向我咨询，以便获得更具体、更专业的法律建议。