撤销行政协议适用起诉期限。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据与起诉期限的确定
根据《最高人民法院关于审理行政协议案件若干问题的规定》第二十五条，公民、法人或者其他组织对行政机关不依法履行、未按照约定履行行政协议提起诉讼的，诉讼时效参照民事法律规范确定；而对行政机关变更、解除行政协议的行政行为提起诉讼的，起诉期限则依照行政诉讼法及其司法解释确定。
不依法履行或未按约定履行行政协议：
- 这类纠纷的诉讼时效参照民事法律规范确定。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，一般的诉讼时效期间为三年，自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
变更、解除行政协议的行政行为：
- 这类纠纷的起诉期限依照行政诉讼法及其司法解释确定。根据《中华人民共和国行政诉讼法》第四十六条，公民、法人或者其他组织直接向人民法院提起诉讼的，应当自知道或者应当知道作出行政行为之日起六个月内提出。法律另有规定的除外。
二、特殊情况下的起诉期限计算
行政机关未告知诉权或起诉期限：
- 若行政机关作出行政行为时未告知诉权或起诉期限，起诉期限从当事人知道或者应当知道诉权或起诉期限之日起计算，但从知道或应当知道行政行为内容之日起最长不得超过一年。
当事人不知道行政行为内容：
- 若当事人不知道行政行为内容，其起诉期限从知道或应当知道该行政行为内容之日起计算，但最长不得超过行政诉讼法规定的最长时效（不动产二十年，其他五年）。
存在不可抗力等特殊情况：
- 因不可抗力或其他不属于当事人自身原因耽误起诉期限的，被耽误的时间不计算在起诉期限内。障碍消除后十日内，可申请延长期限，由人民法院决定。
三、起诉期限与诉讼时效的区别
- 起诉期限：是行政诉讼法规定的，用于限制原告在一定时间内提起诉讼的权利。这个期限一旦届满，通常就不能再对该行政行为提起诉讼。
- 诉讼时效：是民事法律规范中的概念，用于限制权利人行使请求权的期间。在行政协议纠纷中，当涉及不依法履行或未按约定履行行政协议时，会参照民事法律规范中的诉讼时效来确定。
四、建议与注意事项
- 及时行使权利：无论是适用起诉期限还是诉讼时效，当事人都应及时行使自己的权利，避免因超过期限而丧失诉讼机会。
- 了解法律规定：当事人应充分了解相关法律规定，特别是关于起诉期限和诉讼时效的规定，以确保自己的权益得到保障。
- 咨询专业律师：在涉及行政协议纠纷时，当事人可以咨询专业律师，以获取更准确的法律意见和帮助。
总结来看，撤销行政协议适用起诉期限，但具体期限的确定需根据纠纷类型（不依法履行或未按约定履行行政协议、变更或解除行政协议的行政行为）以及是否存在特殊情况来综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。