买卖二手车库的民间协议，只要符合法律规定，是具有法律效应的。以下从不同角度为您详细分析：

一、协议的法律基础

根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，民事法律行为是民事主体通过意思表示设立、变更、终止民事法律关系的行为。买卖二手车库的民间协议，本质上是一种民事法律行为，只要双方意思表示真实，且不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，该协议就是有效的。

二、协议有效的条件

1. 双方意思表示真实：协议必须是双方自愿、平等、协商一致的结果，不存在欺诈、胁迫等情形。
2. 内容合法：协议的内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，如不得涉及非法交易、不得损害国家、集体或第三人的利益等。
3. 形式合法：虽然口头协议在某些情况下也具有法律效力，但为了避免纠纷，建议采用书面形式，并明确双方的权利和义务。

三、协议可能无效的情形

1. 一方以欺诈、胁迫的手段订立合同，损害国家利益：如果一方在订立协议时存在欺诈或胁迫行为，且该行为损害了国家利益，那么该协议是无效的。
2. 恶意串通，损害国家、集体或者第三人利益：如果双方恶意串通，损害了国家、集体或第三人的利益，那么该协议也是无效的。
3. 以合法形式掩盖非法目的：如果协议表面上合法，但实际上是为了掩盖非法目的，如洗钱、逃税等，那么该协议同样无效。
4. 损害社会公共利益：如果协议的内容或目的损害了社会公共利益，如违反环保规定、破坏文物等，那么该协议也是无效的。

四、法律建议

1. 签订书面协议：为了保障双方的权益，建议签订书面协议，并明确车库的基本信息（如位置、面积、结构等）、交易价格、付款方式、交付时间、违约责任等条款。
2. 核实车库权属：在签订协议前，务必核实车库的权属情况，确保卖方有权出售该车库，避免因权属纠纷导致协议无效。
3. 办理相关手续：根据当地规定，可能需要办理车库过户手续或缴纳相关税费。双方应按照规定办理相关手续，确保交易的合法性和有效性。

五、可能的法律后果

如果协议无效或存在纠纷，双方可能面临以下法律后果：

1. 返还财产：如果协议无效，双方应返还因协议取得的财产。
2. 赔偿损失：如果因一方过错导致协议无效或给对方造成损失，过错方应赔偿对方因此遭受的损失。
3. 承担法律责任：如果协议涉及违法行为，双方可能面临行政处罚或刑事责任。

总结：买卖二手车库的民间协议在符合法律规定的情况下是具有法律效应的。但为了避免纠纷和保障双方的权益，建议签订书面协议并核实车库权属情况。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。