股权冻结后，公司章程仍可以备案，但需分情况讨论：

1. 股权冻结本身不影响公司章程备案的合法性
   股权冻结是法院对股东股权的司法限制措施，主要目的是防止股权被转让、质押或处分，确保债权实现。而公司章程备案属于公司内部治理文件的登记行为，两者性质不同。根据《公司登记管理条例》，公司章程的修改或备案是公司自治范畴，只要符合法定程序（如股东会决议通过），即可向市场监管部门申请备案，股权冻结状态不直接导致备案被拒。

2. 需注意冻结裁定中的特殊限制
   若法院在冻结股权时，明确裁定限制公司办理涉及股权变动的登记事项（如章程中涉及股权结构调整、股东权利变更等内容），则备案可能被暂缓。例如：

   • 若章程修改涉及被冻结股权的转让条款（如“冻结股东的股权可由其他股东回购”），可能因违反冻结目的被驳回；
     
   • 若章程仅调整公司治理规则（如董事会职权、利润分配方式），与股权冻结无直接关联，则备案通常不受影响。
     建议：备案前应仔细审查法院冻结裁定内容，必要时与执行法院沟通确认。

3. 实务操作建议

   • 材料准备：提交股东会决议、修改后的章程及全体股东签字文件，确保程序合法；
     
   • 主动披露：在备案申请中说明“部分股东股权被冻结，但章程修改不涉及股权处分”，降低行政机关疑虑；
     
   • 法律风险：若章程修改隐含规避冻结的意图（如通过增资稀释冻结股权比例），可能被认定为恶意，面临行政处罚或司法撤销。

总结：股权冻结不必然阻碍公司章程备案，但需确保修改内容不违反冻结目的。如有特殊条款涉及被冻结股权，建议提前咨询律师或与执行法院协调。若有进一步疑问，可直接向我提问。