结论：土地转让合同中甲方死亡后，合同效力及后续处理需结合合同性质、继承人态度及法律程序综合判断，法院会根据具体情况作出相应处理。以下是具体分析：

1. 合同效力不因甲方死亡自动终止，但需继承人确认

根据《民法典》第1161条，继承人需在继承遗产范围内承担被继承人的债务或权利义务。若土地转让合同已成立且合法，甲方死亡后，其合同权利义务由继承人承继。此时：

• 若继承人同意履行合同：合同可继续执行，继承人需配合办理土地过户等手续；
• 若继承人拒绝履行合同：可能构成违约，乙方可要求继承人承担违约责任（如赔偿损失），或主张解除合同并要求返还已付款项。

关键点：法院会审查继承人是否明确表示接受或放弃继承，以及是否对合同履行提出异议。

2. 中间人及村书记签字的法律意义

中间人签字通常作为见证或担保，村书记签字可能涉及职务行为或个人见证，但二者均非合同生效的法定要件。法院会重点审查：

• 中间人角色：若中间人仅作为见证人，其签字不影响合同效力；若作为担保人，则需承担担保责任；
• 村书记签字性质：若村书记以个人名义签字，属于普通见证；若以村委会名义签字，需审查是否构成职务代理或表见代理（如是否有村委会授权）。

提示：中间人及村书记的签字可能作为辅助证据，证明合同签订过程或甲方真实意思表示，但非决定性因素。

3. 法院处理流程

• 诉讼主体：乙方需将甲方的继承人列为被告，而非已故甲方本人；
• 证据审查：法院会要求乙方提供合同原件、付款凭证、甲方死亡证明、继承人身份证明等材料；
• 调解或判决：法院可能优先调解，促使双方达成继承人与乙方的和解；若调解不成，将根据合同履行情况、继承人态度等作出判决。

4. 特殊情形：合同无效或可撤销

若合同存在以下情形，法院可能宣告无效或撤销：

• 违反法律强制性规定：如土地转让未经村委会同意或未办理审批手续；
• 欺诈、胁迫或显失公平：如甲方生前隐瞒土地权属纠纷，导致乙方利益受损。

建议：乙方应尽快固定证据（如合同、付款记录、沟通记录等），并向法院提起诉讼或申请财产保全，防止继承人转移财产。

总结

甲方死亡后，土地转让合同的履行取决于继承人态度及合同合法性。法院会围绕继承人权利义务承继、合同效力及证据充分性展开审查。如有具体案件细节（如合同条款、付款情况等），可直接向我咨询，我将进一步分析法律风险及应对策略。