公司有借款但不发工资是违法的。以下从不同角度为你详细分析：
法律背景与规定
根据《中华人民共和国劳动法》第五十条的规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这一条款明确规定了公司必须按时足额支付员工工资，不得以任何理由拖欠。公司有借款的情况，并不构成拖欠工资的合法理由。
可能的法律后果
行政处罚：如果公司拖欠工资，劳动行政部门有权责令其限期支付劳动报酬、加班费或者经济补偿。如果逾期不支付，劳动行政部门还可以责令公司按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金。
民事责任：劳动者有权向公司追讨拖欠的工资，并可以要求公司支付因拖欠工资而产生的额外损失，如利息、交通费、误工费等。在极端情况下，如果公司拖欠工资导致劳动者生活困难，劳动者还可以要求公司支付一定的生活费。
刑事责任：虽然一般情况下拖欠工资不构成犯罪，但如果公司以转移财产、逃匿等方法逃避支付劳动者的劳动报酬，或者有能力支付而不支付劳动者的劳动报酬，数额较大，经政府有关部门责令支付仍不支付的，将构成拒不支付劳动报酬罪，依法应承担刑事责任。
实际操作建议
与公司协商：首先，你可以尝试与公司进行协商，了解公司拖欠工资的具体原因，并要求公司尽快支付拖欠的工资。在协商过程中，你可以保留好相关证据，如工资条、银行转账记录等，以备后续维权之需。
向劳动行政部门投诉：如果协商无果，你可以向当地的劳动行政部门（如劳动监察大队）投诉公司的拖欠工资行为。劳动行政部门会依法进行调查处理，并责令公司限期支付拖欠的工资。
申请劳动仲裁或提起诉讼：如果劳动行政部门的处理结果不能满足你的要求，或者公司拒不执行劳动行政部门的决定，你可以向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，或者向人民法院提起诉讼，通过法律途径维护自己的合法权益。
在处理此类问题时，请务必保持冷静和理性，依法维权。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。