针对您提出的“怀孕公司要出差能不能让医院开证明”的问题，以下是我的详细解答：
首先，如果您因怀孕而身体状况不适合出差，确实可以考虑向医院申请开具相关的医疗证明。医院作为专业的医疗机构，有权根据您的身体状况出具相应的诊断意见书或病休证明。这些证明通常包括您的病情、需要休息的时间以及是否适合进行长途旅行或出差等建议。
关于医院证明的法律效力：
就医自主权：您有权从自身病情、就医便利性等角度出发选择合适的医院就诊。企业不应对您的就医自主权过多干涉。
病假证明的认可：企业对于正规医院开具的病假条应当认可。这意味着，如果您能提供医院出具的、证明您因怀孕而不适合出差的医疗证明，企业应当考虑您的实际情况，并可能调整出差安排。
关于企业病假管理制度：
规章制度：虽然企业有权制定病假管理制度，但这些制度必须合法、合理且不违反公平性、便利性等原则。如果企业的规章制度中明确规定了申请病假必须提供的材料，您应当尽量遵守。然而，在特殊情况下（如孕期身体不适），您也可以与企业进行沟通，说明实际情况，寻求合理的解决方案。
病假真实性审核：企业有权对病假的真实性进行审核。如果企业对您提供的医疗证明提出合理性质疑，您可能需要配合企业提供进一步的就诊记录或检查报告等材料。
实际操作建议：
及时沟通：在得知需要出差的消息后，您应尽快与上级或人力资源部门沟通，说明自己因怀孕而不适合出差的情况，并询问是否可以提供医疗证明来调整安排。
准备材料：前往医院就诊时，向医生详细说明自己的身体状况和出差的顾虑，请求医生出具相应的诊断意见书或病休证明。同时，保留好所有的就诊记录、检查报告和医药费单据等材料，以备企业审核。
遵守制度：尽量按照企业的病假管理制度来申请病假。如果企业的制度中有特殊要求（如必须到指定医院复查），您可以与企业沟通，说明自己的实际情况和困难，寻求合理的解决方案。
综上所述，如果您因怀孕而不适合出差，可以向医院申请开具相关的医疗证明，并与企业进行沟通，寻求合理的解决方案。企业应当尊重您的就医自主权，并考虑您的实际情况来调整出差安排。