使用内部管理的店内码是否违法，需结合具体情况判断，一般而言不直接构成违法，但需确保不违反相关法律法规及公平交易原则。以下从不同角度进行分析：

1. 店内码的性质与用途

店内码通常是商家为了内部管理、库存控制或促销活动而自行编制的商品编码。这种编码主要用于商家内部的识别和管理，并不直接涉及商品的法律属性或交易规则。因此，从店内码本身的性质来看，其使用并不直接构成违法。

2. 合法使用的边界

• 不违反价格法规：商家在使用店内码时，应确保不违反价格法规，如不进行价格欺诈、不虚假标注原价等。如果店内码的使用与价格标注相关，且存在误导消费者的行为，则可能构成违法。
• 不侵犯消费者权益：商家应确保店内码的使用不会侵犯消费者的知情权、选择权等合法权益。例如，不应通过店内码隐藏商品的真实信息或限制消费者的选择。
• 符合行业规范：商家在使用店内码时，应遵守所在行业的规范和标准，确保店内码的编制和使用符合行业要求。

3. 可能违法的情形

• 欺诈行为：如果商家通过店内码进行欺诈行为，如故意标注错误的价格、规格或产地等信息，以误导消费者购买，则可能构成违法。
• 不正当竞争：如果商家通过店内码进行不正当竞争行为，如利用店内码进行排他性交易或限制其他商家的竞争，则可能违反反不正当竞争法。
• 违反税收法规：如果商家通过店内码进行偷税漏税行为，如故意隐瞒销售收入或虚报成本等，则可能构成违法。

4. 法律建议

• 合规使用：商家在使用店内码时，应确保其合规性，遵守相关法律法规和行业规范。
• 透明公开：商家应向消费者透明公开店内码的使用目的和方式，避免误导消费者。
• 定期自查：商家应定期自查店内码的使用情况，确保不存在违法违规行为。

如有任何关于店内码使用或相关法律问题的疑问，可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况，提供专业的法律意见和建议。