结论前置：公司作为被执行人的案件中，合作人（即案外第三人）在符合特定条件时，是可以作为案外人提出异议的。

详细分析：

1. 案外人异议的法律依据：

   • 根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释，案外人（即非本案当事人，但与案件处理结果有法律上利害关系的人）在认为执行行为侵犯其合法权益时，有权向执行法院提出书面异议。这一规定为合作人作为案外人提出异议提供了法律基础。

2. 合作人作为案外人的身份认定：

   • 合作人，如果并非被执行案件的直接当事人（如非公司股东、非合同相对方等），但因执行行为（如查封、扣押、冻结公司财产等）可能间接影响到其合法权益（如合作权益、债权等），则其可以作为案外人提出异议。

3. 提出异议的条件：

   • 合法权益受损：合作人必须证明执行行为确实侵犯了其合法权益。这通常要求合作人提供充分的证据，如合作协议、债权凭证等，以证明其与被执行公司之间存在法律关系，且该法律关系因执行行为而受到损害。
   • 异议的时效性：合作人应在知道或应当知道执行行为侵犯其合法权益之日起一定期限内（通常为法定期限内，如15日内）提出异议。逾期提出的，法院可能不予受理。
   • 异议的形式与内容：异议应以书面形式提出，并明确说明异议的理由、事实及法律依据。合作人应详细阐述执行行为如何侵犯其合法权益，以及要求法院采取何种措施（如中止执行、解除查封等）以保护其权益。

4. 异议的处理流程：

   • 法院在收到合作人的异议申请后，会进行初步审查。如果异议申请符合法定形式和条件，法院会立案受理，并通知相关当事人（包括被执行公司和其他利害关系人）进行答辩。
   • 随后，法院会组织听证会或进行书面审查，以查明事实、分清是非。在审查过程中，合作人、被执行公司及其他利害关系人均有权提供证据、发表意见。
   • 最后，法院会根据审查结果作出裁定。如果裁定支持合作人的异议请求，法院会采取相应措施（如中止执行、解除查封等）以保护合作人的合法权益；如果裁定驳回异议请求，合作人可以依法向上一级法院申请复议或提起诉讼。

建议与提醒：

• 如果您作为合作人认为执行行为侵犯了您的合法权益，建议及时咨询专业律师，以便在律师的指导下准备充分的证据材料并提出异议申请。
• 在提出异议前，请务必了解相关法律法规和司法解释的规定，以确保您的异议申请符合法定形式和条件。
• 如果您对法院的裁定结果不服，可以依法向上一级法院申请复议或提起诉讼，以维护自己的合法权益。

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