结论：合同上若明确约定房屋过户的税费、公证费由乙方承担，且未特别排除增值税，则增值税通常也视为由乙方承担。但具体还需结合合同条款的完整表述及双方真实意图来判断。
一、合同条款的直接解读
首先，我们要明确的是，合同是双方意思表示一致的产物，具有法律约束力。当合同中明确约定“房屋过户的税费、公证费由乙方承担”时，这一条款即构成了双方之间的权利义务关系。
税费承担的一般原则：
- 在房屋买卖合同中，税费通常包括契税、个人所得税、增值税（原营业税）等。这些税费的承担方，一般会在合同中明确约定。
- 若合同未明确约定税费的承担方，则可能根据法律规定或交易习惯来确定。但在此案例中，合同已明确约定了部分税费的承担方。
增值税的特殊性：
- 增值税（原营业税）是房屋交易中可能涉及的一项重要税费。其计算方式和承担方，通常也会在合同中明确。
- 若合同中仅提及“税费”由乙方承担，而未特别排除增值税，则从字面意思上看，增值税也应包含在内。
二、合同条款的完整性与双方真实意图
然而，合同的解释并不仅仅局限于字面意思。我们还需要考虑合同条款的完整性以及双方的真实意图。
合同条款的完整性：
- 如果合同中除了约定“房屋过户的税费、公证费由乙方承担”外，还列明了具体的税费种类（如契税、个人所得税等），但并未提及增值税，则可能引发对增值税承担方的争议。
- 在此情况下，我们需要结合合同的整体条款以及交易习惯来综合判断。
双方的真实意图：
- 合同的解释还应考虑双方的真实意图。如果双方在签订合同时，对增值税的承担方有明确的口头约定或书面补充协议，则应以这些约定为准。
- 如果双方对增值税的承担方存在争议，且合同中未明确约定，则可能需要通过协商、调解或诉讼等方式来解决。
三、法律建议与风险提示
法律建议：
- 对于乙方而言，如果合同中未明确排除增值税的承担，且双方对此存在争议，建议乙方先与甲方进行协商，尝试达成一致意见。
- 如果协商无果，乙方可以考虑寻求法律援助或咨询专业律师，以了解自己的权利和义务，并探讨可能的解决方案。
风险提示：
- 乙方应注意，如果合同中确实未明确约定增值税的承担方，且双方无法达成一致意见，则可能面临法律纠纷的风险。
- 在此情况下，乙方可能需要承担额外的税费支出或面临其他法律后果。因此，乙方在签订合同时应尽可能明确各项税费的承担方，以避免后续争议。
总结：合同上若明确约定房屋过户的税费、公证费由乙方承担，且未特别排除增值税，则增值税通常也视为由乙方承担。但具体还需结合合同条款的完整表述及双方真实意图来判断。如有任何疑问或争议，建议乙方及时咨询专业律师以获取法律帮助。