行政处罚立案超过60天并不必然导致程序违法，需结合具体情形判断后续处理方式。根据《行政处罚法》及相关规定，行政处罚案件的办理期限通常为90日（特殊情况可延长），但部分领域（如市场监管、治安管理）可能有单独规定。以下是具体分析：

1. 若案件仍在法定期限内
   根据《行政处罚法》第六十条，行政机关应自立案之日起90日内作出处罚决定（法律、法规、规章另有规定的除外）。若案件复杂需延长，应经机关负责人批准并书面告知当事人。

   • 处理建议：可向行政机关书面询问案件进展，要求其说明是否已申请延期及延期理由。若未依法延期，可主张程序违法。

2. 若已超法定办理期限
   若案件既未在90日内（或特殊领域规定期限内）作出决定，又未依法申请延期，则构成程序违法。

   • 处理建议：
     
     • 行政复议：向上一级行政机关申请复议，请求撤销或变更违法处罚决定；
       
     • 行政诉讼：直接向法院起诉，主张行政机关超期未作为或程序违法，要求撤销处罚或确认违法；
       
     • 证据固定：保留立案通知书、催办记录等证据，证明行政机关超期未履职。

3. 特殊领域期限规定
   部分领域对办案期限有单独规定，例如：

   • 市场监管领域：根据《市场监督管理行政处罚程序规定》，一般案件应在90日内作出决定，经批准可延长30日；
     
   • 治安管理领域：根据《治安管理处罚法》，处罚决定应在立案后30日内作出（经批准可延长30日）。
     
   • 处理建议：先查询案件所属领域的具体规定，确认是否超期。

关键提醒：行政处罚立案超期不直接导致案件终止，但当事人有权通过法律途径监督行政机关依法履职。若遇到此类问题，可直接向我咨询具体应对策略，我会结合案件细节提供进一步分析。