公司起诉要回已支付的经济补偿金，法院一般会受理。具体分析如下：

一. 法院受理案件的条件

1. 原告与本案有直接利害关系：公司作为原告，起诉要求追回已支付的经济补偿金，显然与案件有直接利害关系。
2. 有明确的被告：公司起诉时，必须明确指出被告，即经济补偿金的接收方。
3. 有具体的诉讼请求和事实、理由：公司需要明确其诉讼请求，即要求追回已支付的经济补偿金，并提供相关的事实和理由，如支付错误、对方违约等。
4. 属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖：经济补偿金纠纷属于民事纠纷，且只要公司选择的法院有管辖权，就满足这一条件。

二. 相关法律依据

• 根据《中华人民共和国民事诉讼法》第一百一十九条：“起诉必须符合下列条件：（一）原告是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织；（二）有明确的被告；（三）有具体的诉讼请求和事实、理由；（四）属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。”

三. 实际案例理解

• 例如，某公司因误操作向某员工多支付了经济补偿金，事后发现并要求员工退还，但员工拒绝。此时，公司可以向法院提起诉讼，要求追回多支付的经济补偿金。只要公司提供了充分的证据证明其主张，法院一般会受理并作出相应判决。

综上所述，公司起诉要回已支付的经济补偿金，只要满足法院受理案件的条件，法院一般会受理。如有进一步需要，您可以继续咨询我。