企业员工的行政复议申请应由员工本人提出，但具体申请对象需根据具体行政行为的作出机关及特殊情况来确定。以下是对这一问题的详细分析：

一、一般情况下的申请对象

1. 向作出具体行政行为的行政机关的上一级地方人民政府申请：

   • 例如，若员工对某县公安局的行政处罚决定不服，可向该县人民政府申请行政复议。

2. 向作出具体行政行为的行政机关的上一级主管部门申请：

   • 如某县工商局吊销企业营业执照的决定引发争议，员工可向市工商局提出复议申请。

二、特殊情况下的申请对象

1. 对地方各级人民政府的具体行政行为不服：

   • 应向上一级地方人民政府申请复议。例如，不满某乡人民政府的土地征收决定，应向县人民政府提出复议。

2. 对省、自治区人民政府设立的派出机关所属县级政府的行为不服：

   • 应向该派出机关申请复议。例如，对行政公署下属某县政府的行为有异议，就向行政公署申请。

3. 对国务院部门或省、自治区、直辖市人民政府的行为不服：

   • 直接向作出行为的机关申请复议。如对国家税务总局的决定不服，就向国家税务总局申请复议；对复议决定不服，可提起行政诉讼或向国务院申请裁决。

4. 对垂直领导机关（如海关、金融、国税等）的行为不服：

   • 应向上一级主管部门申请复议。例如，对某海关的处罚决定不满，就向其上级海关申请。

5. 对法律、法规授权组织的行为不服：

   • 向直接管理该组织的地方政府、工作部门或国务院部门申请复议。例如，对高校拒绝授予学位的决定不服，就向教育主管部门申请。

6. 多个行政机关共同名义作出的行为不服：

   • 向其共同的上一级行政机关申请复议。例如，工商局和卫生局联合处罚，不服则向它们的共同上级，即县人民政府申请。

7. 对被撤销机关在撤销前所作行为不服：

   • 向继续行使其职权的机关的上一级机关申请复议。

三、申请注意事项

• 申请人资格：行政复议的申请人应为认为具体行政行为侵犯其合法权益的公民、法人或其他组织，在此场景下即为企业员工。
• 证据提供：申请人应提供充分的证据和理由支持其复议请求，如行政处罚决定书、相关证据材料等。
• 申请期限：行政复议申请一般应在知道具体行政行为之日起六十日内提出，除非法律规定的申请期限更长。因不可抗力或其他正当理由耽误申请期限的，申请期限可从障碍消除之日起继续计算。

四、法律建议

• 明确申请对象：在提出行政复议申请前，员工应首先明确具体行政行为的作出机关，并据此确定正确的申请对象。
• 准备充分证据：员工应收集并整理与具体行政行为相关的证据材料，以支持其复议请求。
• 遵守申请期限：员工应注意行政复议的申请期限，避免因超过期限而丧失复议权利。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。