结论：农业合作社土地被收回后能否继续使用，需根据土地收回的性质、依据及后续安排综合判断，具体分为以下两种情形：

1. 因法定事由收回，且无后续安排：合作社无权继续使用

• 法律依据：根据《土地管理法》《农村土地承包法》等规定，土地收回需基于法定事由（如公共利益需要、土地闲置超期、承包方违约等），且需履行法定程序（如提前通知、补偿安置等）。
• 情形分析：
  • 若土地因公共利益（如修建道路、学校）被依法征收，且征收程序合法，土地所有权将转移至国家或集体，合作社丧失使用权，无权继续使用。
  • 若合作社违反土地用途（如将耕地转为非农建设），或长期闲置土地，行政机关可依法收回土地，此时合作社亦无权继续使用。
• 建议：合作社应核查收回决定是否合法（如是否履行听证、补偿程序），若认为程序违法，可依法申请行政复议或提起行政诉讼。

2. 因合同终止或协商收回，但保留使用权：合作社可继续使用

• 法律依据：若土地收回基于合同约定（如承包期满未续签、双方协商解除合同），但后续通过协商或重新签订合同保留了使用权，则合作社可继续使用。
• 情形分析：
  • 例如，合作社与村集体签订的土地承包合同到期，双方协商续签合同或签订新的使用协议，明确合作社继续使用土地的权利。
  • 或因政策调整（如土地整治项目），合作社虽暂时交回土地，但项目完成后可恢复使用。
• 建议：合作社应与土地所有权人（如村集体）签订书面协议，明确使用期限、用途、费用等条款，避免口头约定引发纠纷。

关键提醒

• 核查收回依据：合作社需确认土地收回是否基于合法事由（如征收、违约）或合同约定，避免因信息不对称导致权益受损。
• 主张补偿权利：若土地被依法征收，合作社有权要求补偿（如土地补偿费、安置补助费、地上附着物补偿费等），具体标准可参考当地政策。
• 协商优先：若土地收回非因法定强制事由，合作社可尝试与所有权人协商，争取保留使用权或获得合理补偿。

如有具体案例或合同条款需分析，可直接向我提问，我将结合实际情况提供详细解答。