在申请劳动仲裁期间，如果劳动合同到期了，这确实是一个比较复杂的情况，需要您根据具体情况来细致处理。以下是我为您整理的详细分析和应对建议：
一、合同到期与劳动关系终止的基本理解
首先，要明确的是，劳动合同期满并不直接意味着劳动关系的立即终止。特别是在劳动仲裁期间，由于存在争议，劳动关系往往处于一种未明确的状态。
二、不同情形下的处理方式
单位维持或提高劳动条件续签：
- 如果用人单位愿意维持或提高劳动合同约定的条件来续签合同，但您作为劳动者不同意续订，那么劳动合同将自然终止。在这种情况下，用人单位无需支付经济补偿，但需要为您办理离职手续，包括出具解除或终止劳动合同的证明，并在十五日内办理档案和社会保险关系转移手续。
单位降低劳动条件续签或单位不续签：
- 如果用人单位降低劳动合同约定的条件来续签合同，或者明确表示不再续签劳动合同，那么您作为劳动者有权要求用人单位支付经济补偿。经济补偿的计算方式是按照您在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。这里的月工资指的是您劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。
存在应当续延的情形：
- 在某些特定情形下，即使劳动合同到期，劳动关系也应续延至相应情形消失时终止。这些情形包括：从事接触职业病危害作业的劳动者未进行离岗前职业健康检查或疑似职业病病人在诊断或医学观察期间；在本单位患职业病或因工负伤并被确认丧失或部分丧失劳动能力；患病或非因工负伤在规定的医疗期内；女职工在孕期、产期、哺乳期；在本单位连续工作满十五年且距法定退休年龄不足五年；以及法律、行政法规规定的其他情形。在这些情况下，如果用人单位以合同到期为由终止劳动关系，您可以主张用人单位的终止行为违法，并要求继续履行劳动合同或主张违法解除劳动合同的赔偿金（赔偿金标准为经济补偿标准的二倍）。
三、应对建议
仔细审查劳动合同条款：
- 特别是关于合同期限、续签或终止的条款，确保您对自己的权益有清晰的认识。
与用人单位进行沟通：
- 表达您的意愿和关切，尝试与用人单位协商解决方案。有时候，通过沟通可以达成双方都能接受的协议。
咨询专业劳动法律师：
- 如果您对处理方式感到不确定或担心自己的权益受到侵害，建议咨询专业劳动法律师以获取更详细的建议和帮助。
准备相关证据和材料：
- 如合同文本、工资单、工作记录等，以支持自己的主张。这些证据在劳动仲裁过程中将起到至关重要的作用。
密切关注劳动仲裁的进展：
- 并遵循仲裁机构的指示和要求。确保您及时了解仲裁的最新动态，并根据需要调整自己的策略。
综上所述，当劳动合同在劳动仲裁期间到期时，您应根据自身情况和法律规定采取相应措施，积极维护自己的合法权益。希望这些分析和建议能对您有所帮助。