汽车维修好了保险公司未及时付钱维修厂扣车不合理。以下是对此问题的详细分析：

一. 维修厂扣车行为的法律分析

1. 合同相对性原则：根据合同法的相关规定，合同是特定当事人之间设立、变更、终止民事权利义务关系的协议。在此案例中，维修厂与保险公司之间、维修厂与车主之间分别存在合同关系，但车主与保险公司之间的合同关系并不直接约束维修厂。因此，维修厂不能因保险公司未及时付钱而直接扣留车主的车辆。

2. 留置权的行使条件：根据《民法典》的相关规定，债权人有权在债务人不履行到期债务时，对已经合法占有的债务人的动产行使留置权。但在此案例中，维修厂扣留车辆并非基于其与车主之间的债务关系，而是基于与保险公司之间的未付款纠纷。因此，维修厂的行为不符合留置权的行使条件。

3. 可能构成侵权行为：维修厂擅自扣留车辆，可能侵犯了车主对车辆的所有权和使用权。如果因此给车主造成损失，维修厂可能需要承担侵权责任。

二. 建议处理方式

1. 沟通协商：首先，维修厂应与保险公司进行沟通，催促其尽快支付维修费用。同时，也可以与车主说明情况，寻求车主的理解和支持。

2. 法律途径：如果保险公司拒不支付维修费用，维修厂可以通过法律途径维护自己的合法权益，如向法院提起诉讼或申请仲裁。但在此过程中，维修厂不应采取扣留车辆等不当手段。

3. 保护车主权益：车主在此事件中是无辜的第三方，其权益应得到保护。如果维修厂的行为给车主造成了损失，车主有权要求维修厂承担赔偿责任。

综上所述，汽车维修好了保险公司未及时付钱时，维修厂扣车是不合理的。维修厂应通过合法途径解决与保险公司之间的纠纷，同时保护车主的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。