局长被刑拘后，其所在单位会暂停其职务，并由执法部门进行深入的调查取证工作。具体处理方式如下：
一. 暂停职务与调查取证
暂停职务：局长被刑事拘留后，其所在的机构通常会暂时停止其职务，以确保调查工作的顺利进行。这是为了避免可能存在的干扰或妨碍调查的行为，同时也体现了对法律程序的尊重。
调查取证：公安机关会对局长涉嫌的违法犯罪行为进行深度调查，收集相关证据。这一过程是确定局长是否构成犯罪的关键步骤。
二. 法律程序与责任承担
法律程序：若经调查取证，证据确凿，局长将会依照法律规定承担相应的刑事责任。整个法律程序将遵循《中华人民共和国刑事诉讼法》等相关法律法规，确保公正、公平。
责任承担：根据《中华人民共和国公职人员政务处分法》的规定，公职人员因故意犯罪被判处管制、拘役或者有期徒刑以上刑罚的，将予以开除。若局长因犯罪被判处相应刑罚，其公职生涯将受到影响。
三. 后续处理与单位决定
人事部门处理：人事部门会根据案件的进展以及司法的判决，按照法律规定采取合适的处置办法。这可能包括终止公职、给予政务处分等措施。
单位决定：局长被刑拘后，其所在单位也会根据情节和影响作出相应决定。若局长的行为对单位造成了重大影响或单位认为其不再适合担任公职，单位有可能会决定将其开除。
四. 合法权益保障
合法辩护权益：在整个法律程序过程中，局长享有合法辩护权益。他可以聘请律师为自己辩护，确保自己的合法权益得到保障。
申诉与救济：若局长对处理结果有异议，他还可以通过申诉、行政复议等途径寻求救济。
我的观点：局长被刑拘后，其所在单位和相关执法部门将依法进行严肃处理。这一过程中，应确保法律程序的公正性和合法性，同时保障局长的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。