农业公司租用地建房是否合法，核心在于是否遵守了土地用途管制制度及是否获得了必要的审批或许可，一般情况下，未经批准擅自改变土地用途来建房是违法的。以下是对此问题的详细分析：
一、土地用途管制制度
我国实行严格的土地用途管制制度，土地被明确划分为农用地、建设用地等类别。农用地主要用于农业生产活动，如耕地、林地、草地等；而建设用地则用于建造建筑物、构筑物，如城乡住宅、公共设施用地、工矿用地等。根据《土地管理法》等相关法律法规，擅自改变土地用途，将农用地转变为建设用地进行非农建设活动，是违反法律规定的。
二、农业公司租用地建房的合法性判断
一般情况下的非法性：
- 农业公司租用农用地建房，若未经过合法审批程序，擅自将农用地转变为建设用地，属于违法行为。
- 相关部门有权责令限期改正或治理，并可处以罚款；若构成犯罪，还将依法追究刑事责任。
特殊情况下的合法性：
- 若在农用地上建设与农业生产直接相关的附属设施，如存放农机具、农产品临时存储等辅助农业生产的建筑，并在符合相关标准和经过合法审批程序的情况下，则是允许的。但这类建筑通常规模较小，且必须严格服务于农业生产。
- 若农业公司计划大规模建设厂房用于工业生产经营等非农建设活动，则必须依法办理农用地转用审批手续，将农用地转为建设用地后方可合法建设。这一过程中，需要向相关部门提交申请，说明建设意图和计划，并等待审批结果。
三、建议与注意事项
了解并遵守法律法规：
- 农业公司在考虑租用地建房之前，应深入了解当地关于土地使用、规划和建设的相关法律法规，确保自身行为合法合规。
确保合规性：
- 即使获得了审批或许可，农业公司也应确保建设活动符合所有相关规定和标准，包括建筑安全标准、环保要求等。避免因不符合规定而面临法律责任和处罚。
及时咨询与沟通：
- 在采取任何行动之前，农业公司应咨询当地法律专业人士或相关政府部门，以获取准确的法律规定和要求。同时，与当地政府部门保持良好沟通，确保行为合法合规。
综上所述，农业公司租用地建房的合法性取决于是否获得了必要的审批或许可，以及是否符合土地用途管制制度的要求。在未获得合法审批前，擅自改变土地用途进行建设是违法的。因此，建议农业公司在考虑此类建设时务必谨慎行事，确保合规性。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。