针对您提出的“公安机关把双重户口中的一个真实原始户口注销了，若行政诉讼是起诉公安机关中的哪个部门”这一问题，以下是我的详细解答：
首先，需要明确的是，当公安机关注销了您认为的真实原始户口时，如果您对此处理结果存在异议，您有权依法进行维权。根据相关法律法规和政策文件，如《广东省公安厅关于进一步妥善处理重复(虚假)户口的意见》等，当事人对公安机关注销户口的处理不服时，有明确的救济途径。
关于行政诉讼的起诉对象：
起诉公安机关的整体行为：在行政诉讼中，您通常不是直接起诉公安机关的某个具体部门，而是起诉公安机关的整体行政行为。这是因为注销户口的决定是由公安机关作出的，代表了公安机关的行政意志。因此，在行政诉讼中，您应将作出注销户口决定的公安机关作为被告。
确定具体被告的依据：在实际操作中，您需要查看注销户口决定书上所盖的公章，以确定是哪个公安机关（如某市公安局、某区分局等）作出的决定。这个公安机关就是您在行政诉讼中需要起诉的被告。
关于行政诉讼的流程：
准备起诉材料：包括起诉状、证据材料（如注销户口决定书、相关身份证明等）以及其他必要的法律文件。
提交起诉：将起诉材料提交至有管辖权的人民法院。一般来说，行政诉讼由最初作出行政行为的行政机关所在地的人民法院管辖。
参与诉讼过程：在诉讼过程中，您需要积极参与，提供证据，陈述事实和理由，以支持您的诉讼请求。
等待法院判决：法院将根据双方提供的证据和法律规定，作出判决。如果判决支持您的诉讼请求，公安机关可能需要撤销其注销户口的决定，并恢复您的户口。
特别提示：
在提起行政诉讼之前，您也可以考虑先向注销户口的公安机关的上级公安机关或者同级人民政府申请行政复议。行政复议是一种相对简便、快速的救济途径，如果复议结果满意，则无需再提起行政诉讼。
无论选择行政复议还是行政诉讼，都需要确保您的请求有充分的法律依据和事实支持。因此，在提起任何法律程序之前，建议您先咨询专业的法律人士或律师，以获取更准确的法律建议和指导。
综上所述，当公安机关注销了您认为的真实原始户口时，您可以在知道或者应当知道该决定之日起六个月内依法向同级人民法院提起行政诉讼，起诉作出该决定的公安机关。同时，您也可以考虑先申请行政复议作为前置程序。