甲方认为乙方不能胜任工作，并不可以直接解除合同，需视具体情况及法定程序而定。以下从不同角度进行详细分析：

一、法律对用人单位解除劳动合同的规定

根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位解除劳动合同需遵循法定程序和条件。其中，关于劳动者不能胜任工作的情形，法律有明确的规定和限制。

1. 不能胜任工作的定义：

   • 不能胜任工作，通常指的是劳动者在经过培训或者调整工作岗位后，仍不能按照劳动合同的约定完成工作任务。

2. 解除劳动合同的法定程序：

   • 当用人单位认为劳动者不能胜任工作时，首先应当对劳动者进行培训或者调整其工作岗位。
   • 如果经过培训或调岗后，劳动者仍不能胜任工作，用人单位可以提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，解除劳动合同。

二、甲方直接解除合同的法律风险

1. 违法解除的风险：

   • 如果甲方未经培训或调岗程序，直接以乙方不能胜任工作为由解除合同，可能构成违法解除。
   • 违法解除劳动合同的，乙方有权要求继续履行合同，或者要求甲方支付赔偿金（通常为经济补偿标准的二倍）。

2. 举证责任：

   • 甲方需承担举证责任，证明乙方确实不能胜任工作，且已经过培训或调岗程序。
   • 如果甲方无法提供充分证据，可能面临败诉风险。

三、建议与操作流程

1. 对乙方的培训或调岗：

   • 甲方应首先对乙方进行必要的培训，或者调整其工作岗位，以帮助其提高工作能力或适应新的工作要求。

2. 书面通知与证据保留：

   • 如果经过培训或调岗后，乙方仍不能胜任工作，甲方应提前三十日以书面形式通知乙方，并保留好相关证据（如培训记录、调岗通知、工作考核等）。

3. 经济补偿与赔偿：

   • 在解除合同时，甲方应按照法律规定向乙方支付经济补偿。
   • 如果甲方违法解除合同，乙方有权要求支付赔偿金。

四、特殊情况下的处理

1. 试用期内的解除：

   • 如果在试用期内，甲方认为乙方不能胜任工作，可以依据《劳动合同法》的相关规定，在证明乙方不符合录用条件的情况下解除合同。但同样需要保留好相关证据。

2. 严重违反公司规章制度的解除：

   • 如果乙方不仅不能胜任工作，还严重违反了公司的规章制度，甲方可以依据相关规定解除合同，但需确保规章制度的合法性和合理性，并已经过公示或告知程序。

总结与建议：甲方认为乙方不能胜任工作时，不能直接解除合同。而应按照法定程序进行培训或调岗，并在确认乙方仍不能胜任工作后，提前三十日以书面形式通知乙方或额外支付一个月工资后解除合同。同时，甲方应保留好相关证据，以应对可能的法律纠纷。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。