在走私案中，若水客已被刑拘但货主未被抓到，针对这种情况如何起诉，核心结论如下：

1. 起诉的主体与对象

   • 起诉主体：通常为公诉机关，即人民检察院。在刑事案件中，检察院代表国家对犯罪嫌疑人提起公诉，追究其刑事责任。
   • 起诉对象：尽管货主目前未被抓到，但若其涉嫌走私犯罪，且证据充分，检察院仍可对其提起公诉。在实际操作中，可能会先对已抓获的水客进行起诉，同时继续追查货主的下落。

2. 起诉的条件与证据

   • 条件：起诉需满足犯罪事实清楚，证据确实、充分，且依法应当追究刑事责任的条件。对于货主而言，即使其未被抓获，只要其走私行为有充分证据证明，即可对其提起公诉。
   • 证据：包括但不限于走私货物的物证、水客的供述与辩解、证人证言、鉴定意见、电子数据等。这些证据需形成完整的证据链，以证明货主的走私行为。

3. 起诉的程序

   • 侦查阶段：公安机关负责侦查，收集证据，查明犯罪事实。若货主未被抓获，公安机关会继续追查其下落。
   • 审查起诉阶段：侦查终结后，案件移送检察院审查起诉。检察院会审查案件证据是否充分，犯罪事实是否清楚，以及是否应当追究刑事责任。对于货主，即使其未在案，检察院也可根据现有证据决定是否对其提起公诉。
   • 审判阶段：若检察院决定提起公诉，案件将进入审判阶段。法院将依法审理案件，并根据证据和法律规定作出判决。

4. 特殊情况的处理

   • 若货主长期未归案：检察院可能会先对已抓获的水客进行起诉和审判。待货主归案后，再根据其犯罪情节和证据情况，决定是否对其另行起诉或追加起诉。
   • 若证据不足：若因证据不足无法对货主提起公诉，检察院可能会作出不起诉决定。但若后续发现新证据，仍可重新提起公诉。

建议：

• 若您是案件相关方，如水客的家属或货主的亲友，建议积极配合公安机关和检察院的调查工作，提供有助于查明案件事实的线索和证据。
• 若您对案件处理有疑问或需要法律帮助，可直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律意见和帮助。