自行达成的协议，在符合一定条件和程序的情况下，是可以申请司法确认的。以下是对这一问题的详细分析：
一、可以申请司法确认的协议范围及条件
适用范围：
- 自行达成的协议，若经过人民调解委员会、行政机关、商事调解组织、行业调解组织或其他具有调解职能的组织调解，并形成了具有民事合同性质的协议，那么该协议在符合条件下可以申请司法确认。例如，双方自行协商后，在社区人民调解委员会的主持下达成邻里纠纷调解协议，或行业协会调解下的商业合作纠纷调解协议等。
申请条件：
- 双方自愿：协议必须是双方当事人真实意愿的表达，不存在欺诈、胁迫等违反当事人自愿原则的情形。
- 内容合法：协议的内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，且不得损害国家利益、社会公共利益以及他人合法权益。
- 属于法院受理范围：协议所涉及的纠纷应属于人民法院受理民事案件的范围，如合同纠纷、财产分割、人身损害赔偿等。
二、申请司法确认的程序
提交申请：
- 当事人应在协议生效之日起三十日内，共同向调解组织所在地的基层人民法院提出司法确认申请。
- 申请时需提交的材料包括：申请书、协议原件、双方当事人的身份证明（如身份证、营业执照等），以及与协议相关的财产权利证明等证明材料。
法院审查：
- 法院收到申请后，将对协议进行形式和实质审查。形式审查主要检查申请材料是否齐全、是否符合法定形式；实质审查则主要审查协议的自愿性、合法性等。
作出裁定：
- 法院经审查后，对于符合条件的协议，将作出确认协议有效的裁定；对于不符合条件的，将裁定驳回申请。裁定一经作出即发生法律效力。
裁定与执行：
- 经法院裁定有效的协议具有强制执行力。若一方当事人拒绝履行或未全部履行协议内容，另一方当事人可以向法院申请强制执行。
三、不可以申请司法确认的情况
- 如果协议存在违反法律规定、损害国家利益、社会公共利益或者他人合法权益等情形，法院将不予确认。例如，协议涉及恶意串通逃避债务、损害国家税收利益等内容。
四、注意事项
- 时间限制：务必在协议生效之日起三十日内提出司法确认申请，逾期法院将不予受理。
- 材料准备：申请时应按照法院要求准备齐全相关材料，以确保申请的顺利进行。
- 费用问题：根据相关规定，司法确认案件属于特别程序案件，法院不收取任何费用。
总结与建议：
自行达成的协议在符合一定条件和程序的情况下，是可以申请司法确认的。通过司法确认程序，可以赋予协议强制执行力，为当事人的合法权益提供更有力的保障。因此，在签订自行达成的协议时，建议双方当事人考虑其内容及后果，并在必要时向法院申请司法确认。如果在此过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。