针对您提出的“动物防疫法规定，运输的生猪未附有检疫证明，由哪个部门处罚，处罚内容是哪些”的问题，以下是我的详细解答：
处罚部门：
- 根据《中华人民共和国动物防疫法》的相关规定，对于运输的生猪未附有检疫证明的违法行为，由县级以上地方人民政府农业农村主管部门负责处罚。
处罚内容：
- 对货主的处罚：依据《中华人民共和国动物防疫法》第一百条，货主若运输未附有检疫证明的生猪，将被责令改正，并处以同类检疫合格生猪货值金额一倍以下的罚款。
- 对承运人的处罚：同样根据该法条，对于货主以外的承运人，若运输未附有检疫证明的生猪，将被处以运输费用三倍以上五倍以下的罚款；情节严重的，处五倍以上十倍以下的罚款。
法律背景与建议：
- 动物检疫是防止动物疫病传播、保障公共卫生安全的重要措施。运输生猪时附有检疫证明，是确保生猪健康、防止疫病扩散的关键环节。
- 对于运输生猪的货主和承运人而言，务必严格遵守动物防疫法规，确保运输的生猪附有有效的检疫证明。这不仅是法律义务，也是对公共卫生安全的负责。
- 若因疏忽或故意违反规定而面临处罚，不仅会造成经济损失，还可能影响企业的声誉和长期发展。因此，建议相关从业者加强内部管理，提高法律意识，确保合规运营。
可能的法律后果：
- 若违反动物防疫法规，除了面临上述行政处罚外，若行为导致动物疫病传播、流行，给他人人身、财产造成损害的，还可能构成犯罪，依法追究刑事责任。
综上所述，运输的生猪未附有检疫证明是严重的违法行为，将面临严格的法律责任。因此，相关从业者务必严格遵守动物防疫法规，确保运输的生猪附有有效的检疫证明。如果您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。