国企占51%、私企占49%的股权结构本身是合法的。以下从多个角度为你详细分析：
法律层面
公司法规定：根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，公司的股权结构由股东自行协商确定，法律并未对国企和私企的持股比例作出限制性规定。因此，国企占51%、私企占49%的股权结构，只要符合公司章程和法律法规的规定，就是合法的。
反垄断法考量：虽然股权结构本身不直接涉及反垄断问题，但如果这种股权结构导致市场垄断或限制竞争，那么可能会受到《中华人民共和国反垄断法》的规制。不过，在大多数情况下，国企和私企的这种持股比例并不足以构成市场垄断或限制竞争，因此无需过分担忧。
实际操作层面
公司治理：国企占51%的股权意味着在股东会或董事会上，国企将拥有相对多数或绝对多数的表决权，这有助于国企在公司治理中发挥主导作用。然而，这并不意味着私企股东的权利被剥夺，他们仍然有权参与公司决策、分享公司利润等。
合作与共赢：国企和私企在股权结构上的合作，可以实现资源共享、优势互补，共同推动公司的发展。例如，国企可能拥有更丰富的资源和更稳定的市场渠道，而私企则可能拥有更灵活的经营机制和更创新的技术。这种合作有助于提升公司的整体竞争力。
潜在风险与注意事项
合规性审查：在设立或变更股权结构时，应确保所有程序都符合法律法规的规定，包括但不限于股东资格审查、股权转让程序、公司章程修改等。
利益冲突与协调：国企和私企在合作过程中可能会存在利益冲突，如经营理念、管理方式等方面的差异。因此，双方应建立有效的沟通机制，及时协调解决合作过程中出现的问题。
监管与合规风险：国企作为国家出资的企业，其经营活动受到更严格的监管。因此，在合作过程中，双方应共同遵守相关法律法规和监管要求，避免因违规行为而引发的法律风险。
总结与建议：国企占51%、私企占49%的股权结构本身是合法的，但双方在合作过程中应关注合规性审查、利益冲突与协调以及监管与合规风险等方面的问题。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询，我会结合你的实际情况为你提供更详细的解答。