结论前置：
- 一般情况下，员工不可以只在一家公司签订劳动合同，而由三家公司发工资。这种操作可能涉及违法用工、税务风险及社保缴纳问题。
- 特殊情况下，如存在关联公司或集团内部调配，需通过合法协议明确权利义务，但仍需遵守劳动法规定。
一、一般情况下的法律分析
在常规的劳动关系中，员工与用人单位签订劳动合同，建立劳动关系，并由该用人单位支付工资、缴纳社保等。若员工只在一家公司签订劳动合同，但工资由三家公司分别支付，这种操作模式可能涉及以下几个方面的法律问题：
违法用工风险：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，用人单位与劳动者建立劳动关系，应当订立书面劳动合同。若工资由非合同签订方支付，可能被视为未与实际支付工资的单位建立劳动关系，从而引发关于是否存在事实劳动关系的争议。
- 若三家公司均未与员工签订劳动合同，但均支付工资，则可能涉及多重劳动关系的问题，这在法律上通常是不被允许的，除非有特别约定或法律允许的情形。
税务风险：
- 工资支付涉及个人所得税的缴纳。若三家公司分别支付工资，且未合理申报纳税，可能涉及偷逃税款的违法行为。
- 税务部门可能要求员工或支付工资的公司补缴税款及滞纳金，甚至面临罚款等法律责任。
社保缴纳问题：
- 社保缴纳通常与劳动关系紧密相关。若员工只在一家公司签订劳动合同，但工资由三家公司支付，可能导致社保缴纳主体不明确，从而影响员工的社保权益。
- 社保部门可能要求补缴社保费用，甚至对用人单位进行处罚。
二、特殊情况下的法律分析
在特殊情况下，如存在关联公司或集团内部调配等情形，可能涉及员工在一家公司签订劳动合同，但由多家公司支付工资的情况。这种情况下，需要特别注意以下几点：
合法协议：
- 关联公司或集团内部应签订合法协议，明确员工与各公司之间的权利义务关系，包括工资支付、社保缴纳等事项。
- 协议应符合法律法规的规定，不得损害员工的合法权益。
遵守劳动法规定：
- 即使存在关联公司或集团内部调配等情形，也应遵守《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规的规定。
- 员工应与实际建立劳动关系的用人单位签订劳动合同，并由该用人单位支付工资、缴纳社保等。
税务合规：
- 关联公司或集团内部应确保工资支付的税务合规性，合理申报纳税，避免偷逃税款等违法行为。
三、建议与风险提示
建议：
- 对于员工而言，应谨慎选择工作方式，确保与用人单位建立合法的劳动关系，并签订书面劳动合同。
- 对于用人单位而言，应遵守法律法规的规定，合理调配员工资源，避免违法用工等风险。
风险提示：
- 若涉及违法用工、税务风险或社保缴纳问题，可能面临法律责任和行政处罚。
- 员工应保留好相关证据，如劳动合同、工资支付记录等，以维护自己的合法权益。
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