针对您提出的“合同总公司签订业务分公司做，钱怎么给分公司”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确总公司与分公司的法律关系。分公司作为总公司的附属机构，并不具备独立的法人资格，其民事责任是由总公司来承担的。因此，从法律层面讲，总公司和分公司可以被视为同一法律主体下的不同组成部分。
接下来，我们分析总公司签合同后付款给分公司的合法性。在符合相关法律法规、合同特别约定以及公司章程的前提下，这种付款行为通常是合法的。但关键在于，总公司和分公司之间需要有明确的内部约定，并且在合同签订前，需要向合同相对方（即客户或供应商）披露这一付款安排。同时，这种安排不能违反法律法规的强制性规定，也不能违背合同的特别约定。例如，如果合同中明确规定了收款方必须是总公司，那么未经对方同意，将款项支付给分公司就可能构成违约。
在实际操作中，为了确保付款的合法性和合规性，并降低潜在风险，我建议您采取以下措施：
合同约定：在合同中详细约定付款条件、方式、时间以及违约责任等条款。特别要明确允许付款给分公司的条款，并确保这一安排得到合同相对方的书面确认。
财务和税务合规：确保付款行为符合相关财务和税务规定。咨询专业税务顾问，了解付款行为可能产生的税务影响，并采取相应的税务筹划措施，以避免税务风险。
内部管理：加强总公司的监管和责任承担，确保分公司有能力履行合同义务。同时，完善内部账务处理和沟通协调机制，保持资金流转的清晰和透明，有相应的记录和审批流程。
风险应对：考虑到付款给分公司可能带来的财务风险（如发票开具主体与收款主体不一致）和履约风险（如分公司经营问题导致合同无法履行），您需要制定相应的风险应对措施。例如，要求分公司提供相应的担保或保证，或者加强总公司的监管力度。
综上所述，总公司签合同后付款给分公司是一个需要谨慎处理的问题。在实际操作中，我建议您咨询专业律师或会计师的意见，以确保所有行为的合法性和合规性，从而维护双方的合法权益。希望这些解答能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。