跟交通肇事者协商好的情况，对工伤鉴定一般没有直接影响。以下从不同角度为你详细分析：
从工伤鉴定流程角度
工伤鉴定有其独立的流程和标准，主要是依据《工伤保险条例》等相关规定，由专门的劳动能力鉴定委员会对工伤职工的劳动功能障碍程度和生活自理障碍程度进行等级鉴定。这一过程主要关注的是职工因工作原因受到事故伤害或患职业病后，身体机能和劳动能力受损的情况。
与交通肇事者的协商，主要是涉及民事赔偿方面的问题，比如赔偿金额、赔偿项目（如医疗费、误工费、护理费等）的确定。这两者在流程上是相互独立的，协商的结果不会改变工伤事故本身的事实，也不会影响劳动能力鉴定委员会依据专业医学标准和规范对工伤职工进行鉴定。例如，即使你与肇事者就赔偿问题达成了协议，但如果你确实因工作原因在交通事故中受伤，且符合工伤认定条件，那么在进行工伤鉴定时，鉴定机构依然会按照法定程序和标准，对你的伤情进行客观评估。
从法律责任角度
交通肇事者的民事赔偿责任和用人单位的工伤保险责任是两种不同的法律责任。交通肇事者承担的是基于侵权行为的民事赔偿责任，而用人单位承担的是基于劳动关系的工伤保险责任。根据相关法律规定，职工因第三人的原因造成工伤，第三人不支付工伤医疗费用或者无法确定第三人的，由工伤保险基金先行支付。工伤保险基金先行支付后，有权向第三人追偿。这意味着，即使你与交通肇事者协商解决了民事赔偿问题，也不影响你依法享受工伤保险待遇，包括进行工伤鉴定和获得相应的工伤赔偿。
特殊情况考虑
虽然一般情况下协商不影响工伤鉴定，但也存在一些特殊情况需要注意。如果在协商过程中，你与肇事者达成了一些特殊的协议，比如约定放弃某些与工伤相关的权利，或者协议内容涉及到对工伤事实的歪曲或隐瞒，那么可能会对后续的工伤认定和鉴定产生不利影响。例如，如果协议中约定你承认此次受伤与工作无关，那么在申请工伤认定时，就可能会因为这一虚假陈述而导致工伤认定不通过，进而无法进行工伤鉴定。因此，在与肇事者协商时，一定要谨慎对待协议内容，避免签署可能损害自己合法权益的条款。
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