关于占地补偿款在总承包与建设单位之间的结算问题，核心结论需结合具体合同条款、项目性质及法律规定综合判断。以下是分情况说明：

1. 合同明确约定补偿款归属及结算方式

若总承包合同或补充协议中已明确约定占地补偿款的分配规则（如按比例分成、固定金额支付等），双方应按合同执行。例如：

• 总承包方负责协调占地并承担费用：补偿款可能全额或部分归总承包方，建设单位按合同约定支付工程款时已包含该成本；
  
• 建设单位直接支付补偿款：合同可能约定补偿款由建设单位直接支付给权利人（如土地所有者），总承包方仅负责协助办理手续，不参与分配。
  

建议：优先核查合同条款，尤其是“费用承担”“补偿款分配”等章节，避免因约定不明引发纠纷。

2. 合同未明确约定，需结合项目性质及法律规定

若合同无约定，需根据项目性质（如政府投资项目、商业开发项目）及法律规定处理：

• 政府投资项目：补偿款通常由建设单位（政府或代建方）根据《土地管理法》《国有土地上房屋征收与补偿条例》等法规直接支付给权利人，总承包方仅按实际完成工程量结算工程款，不涉及补偿款分配；
  
• 商业开发项目：若占地补偿是因建设单位变更设计、扩大用地等导致，补偿款可能由建设单位承担；若因总承包方施工需要（如临时用地），则可能由总承包方承担，并通过工程款调整结算。
  

法律依据：

• 《民法典》第510条：合同生效后，当事人就质量、价款等未约定或约定不明的，可协议补充；不能达成补充协议的，按合同相关条款或交易习惯确定。
  
• 《建筑法》第18条：建筑工程造价应按国家规定的计价规范确定，包含直接费、间接费等，但未明确包含占地补偿款（除非合同约定）。

3. 结算流程的常见操作

无论合同如何约定，结算通常需以下步骤：

1. 权利人确认：补偿款需支付给土地所有者或使用权人，总承包方与建设单位需共同确认权利人身份及补偿标准；
   
2. 凭证提交：总承包方需提供补偿款支付凭证（如银行转账记录、收据）、权利人签字文件等，作为工程款结算的附件；
   
3. 审计与核对：建设单位或第三方审计机构可能核查补偿款的真实性及合理性，避免虚报冒领。
   

风险提示：

• 若总承包方擅自截留补偿款，可能面临建设单位追偿及行政处罚；
  
• 若建设单位拒付约定补偿款，总承包方可依据合同主张权利，甚至通过诉讼解决。

总结建议

1. 核查合同：优先以书面约定为准，避免口头协议；
   
2. 留存证据：补偿款支付过程中保留权利人确认文件、支付凭证等；
   
3. 协商优先：若发生争议，先通过协商或调解解决，降低诉讼成本。
   

如有具体合同条款或项目背景需进一步分析，可直接向我咨询，我会结合细节提供更精准的建议。