水利局一般不能直接对村委与他人签订的水库承包合同提起确认无效民事诉讼，但在特定情形下可能具备相关权利。具体分析如下：

1. 从合同相对性角度
   根据《民法典》合同编规定，合同效力争议原则上应由合同当事人（村委与承包方）提出。水利局作为行政主管部门，并非合同直接利害关系人，通常不具备原告资格。若水利局直接起诉要求确认合同无效，法院可能以”主体不适格”为由驳回起诉。

2. 从行政监管权限角度
   水利局作为水库管理机关，对水库承包行为享有行政监管权：

   • 若承包合同违反《水法》《防洪法》等强制性规定（如影响行洪安全、破坏水资源），水利局可依法作出行政处罚（如责令改正、罚款）；
     
   • 若发现合同签订程序违法（如未履行招标程序、未经村民会议决议），可向乡镇政府或农业农村部门提出查处建议；
     
   • 但行政监管行为与民事诉讼属于不同法律途径，水利局不能通过民事诉讼替代行政执法。

3. 从特殊利害关系角度
   在以下情形中，水利局可能被认定为利害关系人：

   • 国有资源保护：若水库属于国有资产，水利局作为管理单位可依据《民法典》第235条主张返还原物请求权，但需以合同无效为前提；
     
   • 公共利益维护：若合同履行严重损害公共利益（如导致水库功能丧失），水利局可依据《民事诉讼法》第58条以”公益诉讼起诉人”身份提起诉讼，但需符合法定条件（目前仅生态环境损害赔偿领域有明确规定）；
     
   • 授权主体身份：若地方性法规明确授予水利局对特定合同效力的干预权，则可能具备诉讼主体资格。

实务建议：

1. 水利局应优先通过行政途径处理（如发出整改通知、移送纪检监察机关）；
   
2. 若需通过司法程序解决，可建议利害关系人（如村民集体）提起民事诉讼，水利局作为第三人参与；
   
3. 对涉嫌犯罪的违法行为（如贪污贿赂签订合同），应及时移送公安机关。

如需进一步分析具体合同条款或地方性法规，可直接向我提供详细信息。