擅自改变船只用途的处罚依据主要依据相关的水上交通管理法规和船舶管理规定，以下从不同角度为您详细分析：

一、法律依据

1. 《中华人民共和国海上交通安全法》：该法规定了海上交通安全的基本要求，包括船舶的航行、停泊、作业等行为规范。虽然该法并未直接规定擅自改变船只用途的具体处罚，但为海上交通管理提供了基本框架，擅自改变船只用途可能违反该法关于船舶安全航行的相关规定，从而受到相应的行政处罚。

2. 《中华人民共和国内河交通安全管理条例》：该条例明确规定了内河交通安全管理的要求，包括船舶的登记、检验、航行规则等。根据该条例，擅自改变船只用途，如将货运船改为客运船而未进行相应变更登记和检验，可能面临警告、罚款等行政处罚。具体处罚措施可能包括责令改正、罚款（罚款数额根据违规情节的严重程度而定，可能从几千元到几万元不等），甚至可能吊销船舶检验证书、船舶登记证书等。

3. 《中华人民共和国渔业法》（如涉及渔业船舶）：若擅自改变的船只属于渔业船舶，且改变了其渔业用途，如将捕捞船改为养殖船而未进行相应变更登记，则可能违反《中华人民共和国渔业法》的相关规定。根据该法，可能面临没收违法所得、罚款等处罚，罚款数额同样根据违规情节的严重程度而定。

二、处罚类型与后果

1. 行政处罚：

   • 警告：对于情节较轻的违规行为，相关部门可能首先给予警告，要求立即改正。
   • 罚款：根据违规情节的严重程度，罚款数额可能有所不同。一般来说，罚款数额会考虑违规行为的性质、持续时间、对水上交通安全的影响等因素。
   • 吊销证书：对于情节严重的违规行为，如多次擅自改变船只用途且拒不改正，相关部门可能吊销船舶检验证书、船舶登记证书等，导致船舶无法合法航行。

2. 刑事责任：在极端情况下，如擅自改变船只用途导致严重水上交通事故，造成人员伤亡或重大财产损失，相关责任人可能面临刑事责任的追究。

三、实际案例与建议

• 实际案例：曾有案例显示，某货运船擅自改为客运船并载客航行，因未进行相应变更登记和检验，且船舶结构、设备不符合客运要求，导致航行过程中发生事故。最终，船主被处以罚款，并吊销了船舶检验证书和船舶登记证书。

• 建议：

  • 遵守法规：船主应严格遵守水上交通管理法规和船舶管理规定，不得擅自改变船只用途。
  • 及时变更登记：如需改变船只用途，应及时向相关部门申请变更登记，并进行相应的检验和审批。
  • 加强安全管理：船主应加强船舶的安全管理，确保船舶结构、设备符合航行要求，保障水上交通安全。

如有任何关于水上交通管理法规或船舶管理规定的疑问，或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业的法律意见和帮助。