结论前置：相关单位缺少证据时，案件查办可能面临证据不足、无法定案、补充侦查或撤案等结果，具体影响需结合案件性质、证据类型及法律程序综合判断。以下是详细分析：

1. 刑事案件：证据不足可能导致撤案或不起诉

• 侦查阶段：若公安机关收集的证据无法证明犯罪事实存在，或证据链断裂（如缺少物证、证人证言矛盾），根据《刑事诉讼法》第163条，公安机关可能撤销案件，终止侦查。
• 审查起诉阶段：检察院审查后认为证据不足、不符合起诉条件的，可依据《刑事诉讼法》第175条作出不起诉决定（存疑不起诉）。此时案件不会进入审判程序，犯罪嫌疑人可能被释放。
• 审判阶段：若法院审理时发现证据不足，无法形成完整证明体系，可能依据《刑事诉讼法》第200条判决无罪（“证据不足，不能认定被告人有罪的，应当作出证据不足、指控的犯罪不能成立的无罪判决”）。

2. 民事案件：证据不足可能导致败诉或调解

• 举证责任分配：民事诉讼遵循“谁主张，谁举证”原则。若原告无法提供充分证据证明其主张（如合同纠纷中缺少书面协议、借款纠纷中无转账记录），法院可能依据《民事诉讼法》第67条驳回其诉讼请求。
• 调解或撤诉：实践中，若证据明显不足，原告可能主动撤诉或接受调解，以避免败诉风险。
• 例外情形：部分案件适用“举证责任倒置”（如环境污染、医疗损害责任纠纷），此时被告需承担举证责任。若被告无法提供反证，可能承担不利后果。

3. 行政案件：证据不足可能导致撤销行政行为

• 行政诉讼举证规则：根据《行政诉讼法》第34条，被告（行政机关）对作出的行政行为负有举证责任。若行政机关无法提供充分证据证明其行政行为合法（如处罚决定缺少事实依据或程序违法），法院可能判决撤销或部分撤销该行政行为。
• 程序瑕疵影响：即使行政行为实体合法，若程序证据缺失（如未告知听证权利、未送达文书），也可能因程序违法被撤销。

4. 补充侦查或证据补强的可能性

• 刑事案件补充侦查：检察院审查起诉时，若认为证据不足，可依据《刑事诉讼法》第175条退回公安机关补充侦查，最多两次。若补充后仍证据不足，则作出不起诉决定。
• 民事/行政案件证据补正：当事人可在举证期限内补充证据，或申请法院调查取证（如申请法院调取银行流水、监控录像等）。若逾期未提供且无正当理由，可能承担不利后果。

5. 对当事人的影响及建议

• 当事人权利：若因证据不足导致案件不利，当事人可依法申请复议、上诉或申诉（如刑事案件中被告人被判无罪后，检察院抗诉；民事案件中当事人上诉）。
• 实务建议：
  1. 及时固定证据：在纠纷发生时，通过书面协议、录音录像、第三方见证等方式保留证据。
  2. 申请证据保全：对可能灭失的证据（如电子数据、证人证言），可向法院申请证据保全。
  3. 咨询专业律师：证据规则复杂，需结合具体案情分析证据效力（如证据的合法性、关联性、真实性）。

总结：证据是案件查办的核心，缺少证据可能导致程序终止、败诉或行政行为撤销。当事人应重视证据收集与保存，必要时通过法律程序补强证据或维护权益。如有具体案件，可进一步向我咨询细节。