有新证据可以在判决生效两年内申请再审，但需满足特定条件。以下是对此问题的详细分析：

一、法律依据

根据《中华人民共和国民事诉讼法》第二百零六条的规定，当事人申请再审的情形包括有新的证据，足以推翻原判决、裁定的。这意味着，如果当事人发现了新的证据，且该证据足以改变原判决、裁定的结果，那么他们有权向上一级人民法院申请再审。

二、申请再审的时间限制

1. 一般时间限制：当事人申请再审，应当在判决、裁定发生法律效力后六个月内提出。这是为了维护生效裁判的既判力和司法秩序的稳定性。
2. 特殊时间限制：然而，如果存在特定情形，如有新的证据等，当事人可以自知道或者应当知道之日起六个月内提出再审申请。这一规定为当事人提供了在发现新证据后申请再审的合法途径。

三、申请再审的条件与程序

1. 条件：除了有新的证据外，申请再审还需满足其他条件，如原判决、裁定认定的基本事实缺乏证据证明、原判决、裁定认定事实的主要证据是伪造的等。这些条件共同构成了申请再审的法定门槛。
2. 程序：当事人需要向上一级人民法院提交再审申请书及相关材料。人民法院会对再审申请进行审查，判断是否符合再审条件。经审查认为符合再审条件的，会裁定再审；认为不符合再审条件的，会裁定驳回申请。

四、注意事项

1. 再审不影响执行：在再审期间，原判决、裁定一般不停止执行。除非有特殊情况，如当事人申请并提供担保等，人民法院可以决定中止执行。
2. 再审结果不确定：即使申请了再审，也不一定能改变原判决、裁定的结果。再审的结果取决于案件的具体情况和法律规定。因此，当事人在申请再审前应充分评估新证据的证明力和再审成功的可能性。

五、特殊情况说明

虽然一般情况下，判决生效两年后可能因超过申请再审的常规期限而难以启动再审程序，但如果有新的证据且该证据足以推翻原判决、裁定，并且当事人能在自知道或应当知道该新证据之日起六个月内提出再审申请，那么仍有可能获得再审的机会。不过，这并不意味着可以无限期地拖延申请再审的时间，因为“自知道或者应当知道之日起六个月内”这一规定仍然是对当事人申请再审时间的限制。

建议：如果您发现了新的证据，并且认为该证据足以推翻原判决、裁定，那么您应及时向上一级人民法院申请再审。在申请再审前，建议您充分评估新证据的证明力和再审成功的可能性，并准备好相关的再审申请书及材料。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。