法院会受理拖欠工资超过三年的案件，但劳动者可能面临败诉风险。以下是对这一问题的详细分析：

一、法院受理情况

1. 受理原则：根据法律规定，劳动争议案件需先经劳动仲裁前置程序。若仲裁委因超过仲裁时效而不予受理，劳动者可以凭不予受理通知书去法院起诉，法院会受理此类案件。
2. 时效抗辩：虽然法院会受理，但如果对方以时效抗辩，且法院查明无时效中止、中断情形，劳动者可能败诉。

二、仲裁时效与诉讼时效

1. 仲裁时效：劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或应当知道其权利被侵害之日起计算。但劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的，劳动者申请仲裁不受一年仲裁时效期间的限制；劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出。
2. 诉讼时效：向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。但劳动争议案件中，若存在时效中断等情形，诉讼时效会重新计算。

三、时效中断情形

若存在以下情形之一，会导致仲裁时效或诉讼时效中断，从中断时起，时效期间重新计算：

1. 向对方主张权利：如劳动者向用人单位主张过工资。
2. 向有关部门请求权利救济：如向劳动监察部门投诉。
3. 用人单位同意履行义务：如用人单位曾承诺支付工资。

四、法律建议

1. 及时主张权利：为避免时效问题，劳动者应及时向用人单位主张工资，或向有关部门请求权利救济。
2. 保留证据：劳动者应保留好劳动合同、工资条、考勤记录等能证明劳动关系及工资数额的证据，以便在仲裁或诉讼中维护自身合法权益。
3. 咨询专业律师：虽然我作为律师已经给出了专业建议，但每个案件的具体情况都有所不同。如果劳动者在处理此类纠纷时遇到困难，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供更详细的法律建议。

举例说明：假设劳动者A在2019年离职后，发现用人单位B拖欠其2018年的工资。A在2022年才向劳动仲裁委申请仲裁，此时已超过一年的仲裁时效。但若A能证明在2019年至2022年期间曾向B主张过工资，或向有关部门请求过权利救济，则仲裁时效会中断并重新计算。此时，A的仲裁申请仍有可能被受理，且若仲裁后不服，还可以向法院起诉。

综上所述，虽然拖欠工资超过三年法院会受理，但劳动者应尽可能在时效期间内主张权利，并保留好相关证据，以维护自身合法权益。