三方协议盖的章没有编号，在大多数情况下并不影响协议的法律效力，但具体还需根据协议内容、盖章主体及法律规定综合判断。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 公章编号的法律意义

公章编号是公安机关对公章进行备案后赋予的唯一标识，用于区分不同单位的公章。然而，公章编号并非公章生效的法定要件。根据《中华人民共和国民法典》等相关法律规定，只要公章是真实、有效的，且代表单位真实意思表示，即使没有编号，也不影响其法律效力。

2. 三方协议的有效性

三方协议是三方当事人之间设立、变更、终止民事权利义务关系的协议。其有效性主要取决于以下几个方面：

• 当事人意思表示真实：三方协议必须基于各方当事人的真实意思表示，不存在欺诈、胁迫等情形。
• 内容合法：协议内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，不得违背公序良俗。
• 形式要件：虽然公章编号不是法定要件，但协议应当加盖各方当事人的真实公章或合同专用章，以证明协议的真实性和合法性。

3. 无编号公章可能带来的风险

尽管无编号公章在法律上可能不影响协议效力，但在实际操作中，无编号公章可能引发一些风险：

• 真实性难以确认：无编号公章可能增加协议真实性的确认难度，尤其是在发生纠纷时，对方可能质疑公章的真实性。
• 管理风险：无编号公章可能反映出单位在公章管理上的不规范，增加内部管理风险。
• 交易安全：对于第三方而言，与使用无编号公章的单位进行交易可能面临更高的交易安全风险。

4. 建议与措施

• 完善公章管理：单位应建立健全公章管理制度，确保公章的合法、合规使用，包括及时备案并获取公章编号。
• 增强协议保障：在签订三方协议时，除了加盖公章外，还可以考虑增加法定代表人或授权代表的签字，以及附上相关证明文件，以增强协议的法律效力。
• 及时咨询专业律师：如果对公章的使用或协议的法律效力存在疑虑，建议及时咨询专业律师，以获取更具体的法律建议。

总结来看，三方协议盖的章没有编号，在法律上并不必然导致协议无效。但为了确保协议的法律效力和交易安全，建议单位规范公章管理，及时备案并获取公章编号。同时，在签订协议时，应确保各方当事人的真实意思表示，并遵守相关法律法规的规定。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。