申请异地管辖权后，案件本身不会因管辖权异议的提出而自动撤销，是否撤诉取决于原告的自主决定及法院的审查结果。以下从不同角度展开分析：

一、管辖权异议审查期间：原告可自主决定是否撤诉

1. 法律赋予原告撤诉权
   根据《中华人民共和国民事诉讼法》第一百四十五条，宣判前原告申请撤诉的，是否准许由人民法院裁定。这意味着在管辖权异议审查期间，若原告认为继续诉讼成本过高、证据不足或达成和解等，可主动向法院提交撤诉申请。

2. 法院审查撤诉的合法性
   法院不会直接批准所有撤诉申请，而是会审查两个核心条件：

   • 自愿性：撤诉必须是原告真实意思表示，不得受胁迫或误导；
     
   • 不损害他人权益：撤诉不得损害国家、集体或第三人的合法权益。
     例如，若案件涉及公共利益（如环境污染），法院可能拒绝撤诉。

3. 实践中的操作流程
   原告需提交书面撤诉申请，法院在收到申请后，会结合管辖权异议的审查进度综合判断。若管辖权异议尚未裁定，且撤诉申请符合条件，法院通常会在裁定管辖权异议前处理撤诉事宜。

二、管辖权异议裁定后：撤诉限制增加

1. 异议成立：案件移送，撤诉需重新申请
   若法院裁定管辖权异议成立，案件将移送至有管辖权的法院。此时，原法院不再拥有审理权，原告若想撤诉，需向新受理的法院重新提交申请。新法院会再次审查撤诉的合法性，程序上更为复杂。

2. 异议不成立：案件继续审理，撤诉仍需法院批准
   若法院裁定驳回管辖权异议，案件继续在原法院审理。原告此时申请撤诉，仍需满足自愿性和不损害他人权益的条件，法院会依法裁定是否准许。

三、关键风险提示：撤诉≠案件终结

1. 撤诉后可能面临再诉限制
   根据《民事诉讼法》及相关司法解释，原告撤诉后，若以同一事实和理由再次起诉，法院可能不予受理（除非有新证据或情况变化）。因此，撤诉需谨慎评估。

2. 被告权益保护
   若原告撤诉后再次起诉，被告可能面临重复应诉的成本。因此，被告可在撤诉阶段提出异议，要求法院审查撤诉的合理性。

四、实务建议：如何操作更稳妥？

1. 若想撤诉：

   • 尽早提交书面撤诉申请，避免与管辖权异议裁定时间冲突；
     
   • 明确撤诉原因（如和解、证据不足），并确保不损害他人权益；
     
   • 与法院沟通，确认撤诉申请是否在管辖权异议裁定前处理。

2. 若不想撤诉：

   • 积极应诉，准备管辖权异议的答辩材料；
     
   • 关注法院裁定结果，若异议成立，及时与新受理法院联系；
     
   • 若异议不成立，继续在原法院参与诉讼程序。

总结：申请异地管辖权后，案件不会因管辖权异议而自动撤销，原告是否撤诉需结合自身意愿和法院审查结果。建议根据案件进展，及时与法院沟通撤诉或应诉策略，以降低诉讼风险。如有具体案件，可进一步向我咨询细节。