针对您提出的“逾期协商只还本金后面还有违约金吗怎么办”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，逾期还款后是否需要支付违约金，这主要取决于您与债权人之间签订的合同条款内容。在大多数情况下，如果合同中已经明确规定了逾期还款将会产生相应的违约金或罚息，并且此项条款具有法律效力，那么在您将本金全部偿清之后，仍然可能需要承担违约金或罚息的责任。
然而，也存在一些特定情形，您可能有机会减轻或免除部分违约金：
违约金约定过高：如果合同中约定的违约金金额过高，超出了法律所允许的范畴，您可以考虑通过与债权人进行协商，或者采取法律手段来主张减轻或免除部分违约金。在此情况下，您可以咨询专业律师，了解相关法律规定，并据此与债权人进行谈判。
不可抗力等外部原因：如果逾期是由于不可抗力等外部原因导致的，例如自然灾害、政策变动等，您也可以考虑与债权人协商，看是否能够减轻或免除部分违约金。在此情况下，您需要提供相关证据来证明逾期并非由您个人原因造成。
针对您当前的情况，我建议您采取以下步骤：
与债权人充分沟通：首先，尝试与债权人进行充分的沟通，阐述自己所面临的困境和实际情况，看是否能够达成双方都能接受的解决方案。例如，您可以提出分期偿还违约金、延长还款期限等建议。
收集并整理相关证据：如果协商无果，同时您又觉得自己的权益受到了不应有的侵蚀，此时您可以收集并整理相关的证据材料，如合同条款、逾期原因证明等，以备后续可能需要的法律程序。
考虑法律手段：如果与债权人的协商未能达成一致，您可以考虑向当地人民法院提交上诉申请，由法院依据相关法规来判断违约金的合理性以及应当支付的具体数额。在此过程中，建议您咨询专业律师，以获取更专业的法律建议和支持。
总之，逾期还款后是否需要支付违约金，主要取决于合同条款内容和相关法律规定。在处理此类问题时，建议您保持冷静、理性，并积极与债权人进行沟通协商，以寻求最佳解决方案。