构成妨碍公务罪但法院未判，且已过20年，关于赔偿的问题，需分情况讨论：

1. 若当时未被追究刑事责任，也未涉及民事赔偿：

   • 在这种情况下，由于时间已经过去20年，且当时并未涉及民事赔偿的判决或协议，从法律程序上讲，现在再主动提起民事赔偿请求可能会面临诸多困难。因为民事诉讼通常有时效限制，虽然某些情况下时效可能中断或延长，但20年的时间跨度通常会使时效问题变得复杂。
   • 建议：您可以尝试与当时涉及的公务人员或相关单位进行协商，看是否能达成某种形式的补偿协议。但请注意，这种协商并不具有法律强制力，结果取决于双方的意愿和谈判能力。

2. 若当时虽未被判刑，但已涉及民事赔偿部分且未履行：

   • 如果在妨碍公务的行为发生时，已经通过某种方式（如调解、和解等）确定了民事赔偿的金额和方式，但一直未履行，那么现在对方仍有权要求您履行赔偿义务。不过，同样会受到时效的限制，但具体是否受时效影响还需看当时的协议或调解书中的具体条款。
   • 建议：您应首先审查当时的协议或调解书，了解其中的赔偿条款和时效规定。如果确实存在未履行的赔偿义务，且时效问题不影响执行，那么您应尽快与对方联系，履行赔偿义务，以避免可能的法律纠纷。

3. 关于时效的特别说明：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，民事权利的诉讼时效期间通常为三年，但自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。在妨碍公务罪的情境下，如果涉及的是对公务人员人身或财产的损害赔偿，那么同样可能受到这一时效规定的限制。
   • 但需注意：时效的计算和适用可能因具体情况而异，如是否存在时效中断、中止等情形。因此，在具体操作中，建议您咨询专业律师以获取更准确的法律意见。

4. 若希望寻求法律救济：

   • 鉴于时间已经过去20年，且情况复杂，如果您认为自己的权益受到了侵害，且希望寻求法律救济，那么建议您尽快咨询专业律师（不过在这里，您可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供法律意见）。律师将能够根据您的实际情况，结合相关法律法规，为您制定合适的法律策略。

总结来说，构成妨碍公务罪但法院未判，且已过20年的情况下，关于赔偿的问题需根据具体情况来讨论。如果当时未涉及民事赔偿或已涉及但未履行，现在再提起赔偿请求可能会面临时效等法律问题。因此，建议您根据实际情况，选择合适的解决方式，并在必要时咨询专业律师以获取更准确的法律意见。