借用土地埋军用设施是否违法，需分情况讨论，核心结论如下：

1. 若土地性质为军用且已依法确权
   根据《中华人民共和国军事设施保护法》第二条，军用训练场、试验场等属于军事设施，包括为执行任务必需设置的临时设施。若土地已依法确权为军用（如案例中某军分区通过土地行政主管部门颁发国有土地使用权证），则任何单位或个人未经权利人同意占用土地均构成侵权。
   法律后果：权利人可依据《民法典》第二百三十五条要求返还原物，侵权人需承担停止侵害、恢复原状等民事责任；若涉及破坏军事设施，还可能触犯《刑法》第三百六十九条，面临刑事处罚。

2. 若土地性质存疑或未确权
   若土地权属存在争议（如案例中村委会误登记为集体土地），需先通过行政程序确认权属。在权属未明确前，擅自占用可能涉及以下风险：

   • 行政责任：违反《土地管理法》第七十七条，非法占用土地的，由县级以上人民政府自然资源主管部门责令退还土地，限期拆除或没收地上建筑物。
     
   • 民事责任：若最终确权为军用土地，占用方需承担返还原物、赔偿损失等责任。
     
   • 刑事责任：若占用行为导致军事设施严重损坏，可能构成破坏军事设施罪。

3. 特殊情形：临时借用需合法程序
   即使因特殊需求（如紧急军事行动）需临时借用非军用土地，也应通过法定程序：

   • 协商补偿：与土地所有权人/使用权人协商，签订临时借用协议并给予合理补偿。
     
   • 行政审批：若涉及集体土地，需依法办理农用地转用审批手续；若涉及国有土地，需符合规划并经相关部门许可。
     风险提示：未经合法程序占用土地，即使出于“军用”目的，仍可能被认定为违法。

法律建议：

• 确权优先：借用前务必核实土地权属，可通过查询不动产登记信息或咨询当地自然资源部门确认。
  
• 程序合规：若需长期使用，建议通过政府划拨、征收或协议购买等方式取得合法使用权；临时使用需签订书面协议并留存证据。
  
• 风险防范：避免因“军用”名义忽视法律程序，军事设施保护与土地管理法规均需严格遵守。

案例启示：
案例中甲公司、乙公司因未核实土地权属，最终被判返还土地并承担执行费用。这提示我们，无论土地用途如何，合法性审查是前提，程序合规是保障。

如有进一步疑问（如具体操作流程、权属争议解决等），可直接向我咨询，我将结合您所在地区的政策提供详细方案。